猪链球菌2型98 HAH33株脂蛋白的in silico方法鉴定 (2008年)

为鉴别已公布基因组序列的SS2 98HAH33株的脂蛋白,以研究脂蛋白在SS2致病过程中的作用,首先利用PrositeScan和DOLOP脂蛋白预测软件预测98 HAH33株的脂蛋白,采用SignalP 3. 0 HMM , PrediSi, Phobius和LipoP-HMM分析预测的脂蛋白的信号肽,然后经“多数票决法”鉴定脂蛋白,最后利用 InterProScan和BlastP服务器对鉴定的脂蛋白进行功能分析。结果鉴定出31种脂蛋白,占SS2致病株 98 HAH33蛋白质组的1.465%。功能分析结果