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matlab最简单的代码-diffusion-maps:在Python中快速计算扩散图和几何谐波
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2021-05-22
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matlab最简单的代码Python的扩散图和几何谐波 概述 适用于Python的diffusion-maps图库提供了扩散图[fn:1]和几何谐波[fn:2]的快速且准确的实现。 它的速度源于稀疏线性代数和(可选)图形处理单元的使用,以加快计算速度。 在具有超过2亿个非零条目的矩阵上,所包含的代码通常使用GPU来解决SciPy特征值问题的速度比SciPy快3倍。 该软件包包括一个命令行实用程序,用于快速计算数据集上的扩散图。 diffusion-maps模块的一些功能包括: 使用最近的邻居快速评估距离矩阵。 使用稀疏线性代数快速准确地计算特征值/特征向量对。 可选的GPU加速的稀疏线性代数例程。 库的可选接口。 简单且易于修改的代码。 [fn:1] Coifman,RR,&Lafon,S.(2006)。 扩散图。 应用与计算谐波分析,21(1),5-30。 [fn:2] Coifman,RR,&Lafon,S.(2006)。 几何谐波:一种用于经验函数的多尺度样本外扩展的新颖工具。 应用与计算谐波分析,21(1),31–52。 先决条件 该库在Python 3.5+中实现,并使用和。
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diffusion-maps-master.zip (36个子文件)
diffusion-maps-master
GNUmakefile 571B
geometric-harmonics.png 196KB
LICENSE 1KB
setup.cfg 97B
diffusion_maps
diffusion_maps.py 16KB
gpu_eigensolver.py 9KB
command_line_interface.py 8KB
cusparse.py 6KB
utils.py 1KB
tests
test_diffusion_maps.py 4KB
test_eigensolver.py 966B
test_geometric_harmonics.py 7KB
misc.py 1KB
__init__.py 0B
matrix_vector_product.py 2KB
profiler.py 745B
default.py 362B
clock.py 2KB
__init__.py 140B
geometric_harmonics.py 3KB
plot.py 3KB
cpu_eigensolver.py 1KB
version.py 190B
doc
conf.py 5KB
make.bat 818B
modules.rst 79B
diffusion_maps.rst 2KB
Makefile 611B
index.rst 500B
README.org 3KB
setup.py 1KB
.gitignore 46B
conda-recipe
bld.bat 237B
meta.yaml.in 595B
build.sh 220B
scripts
make-version 493B
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