MATLAB用拟合出的代码绘图效果大小相关
模拟研究
仿真提醒v1
有关UKBB归因的问题:
检查“原始基因型”是否被归入“推断基因型”
看看如何通过相同的UKBB程序进行插补
确保所有的内容都被填充到“推定的基因型”中
对于“原始基因型”中的Kong,可以将其视为空基因型,插补然后保留Kong
真正的SNP效应大小相关性(我们创造了术语“遗传效应相关性”以供参考)是我们估算的目标
GWAS效应大小估计的经验相关性应该是“遗传相关性”的最直接估计,但是LD将影响估计。
一种方法是从LD上解开“
GWAS效应大小相关估计”,另一种方法是使用外部生物学知识或信息来增强估计的能力
概念
我们如何分解“遗传效应相关性”
?
假设两个SNP具有很强的效应相关性,这意味着它们在所有性状上的功能相似:例如,影响同一基因,对细胞类型具有相似的功能。
进一步的理解是,两个SNP不仅显示出因果关系行为,而且具有相似的作用方向模式-同时有益或有害。
它看起来像一个两步过程。
遗传效应相关性是SNP方式的,这意味着两个SNP的效应大小被认为与同一性状相关,而不是被视为IID。
它与遗传相关性的关系是,一个是列
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