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彩色补偿的matlab代码-NDPanalysis:NDPanalysis:使用MATLAB和MATLAB分布式计算服务器对大规...
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2021-05-23
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彩色补偿的matlab代码NDP分析 NDPanalysis:使用MATLAB和MATLAB分布式计算服务器对大规模活动诱发的IEG图像进行全自动定量和快速分析的系统。 目前,将与神经活动相关的即早基因(IEG,例如Arc和Homer 1a)表达的荧光原位杂交(FISH)与共聚焦显微镜相结合,以确定近期神经活动的模式。 然而,由于图像采集和分析时间的缘故,这种方法在可分析的脑组织数量方面受到严格限制。 我们正在评估使用自动扫描显微镜(Hamamatsu NanoZoomer 2.0-RS,奥林巴斯)的能力,该显微镜能够在相对较短的时间内以高分辨率自动捕获整个大脑区域的宽视野多光谱荧光图像堆栈。 压缩后,此类图像数据集可以高达8GB,并以特殊的图像格式NDPI存储。 当前,没有能够读取和处理如此大的图像数据集的软件工具。 我们开发了一个全面的软件工具-NDPanalysis-使用较不精确但较快的方法(“快速而肮脏”)处理由Nanozoomer显微镜采集的超大型多光谱图像或图像堆栈。 该GUI软件平台能够将整个图像数据集加载到计算机上,并以相对较低的分辨率显示。 用户可以选择ROI,旋转图
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NDPanalysis-master.zip (46个子文件)
NDPanalysis-master
AdjustBrightness.asv 4KB
Findnearest.asv 761B
startup.m 123B
NDPpreprocess.exe 562KB
NDPanalysis.fig 15KB
Findnearest2.m 723B
medfilt3.m 6KB
NDPanalysis.asv 38KB
FITCfoci3D.m 11KB
NDPanalysis.m 39KB
Findnnpair.asv 928B
Doublefoci3D_wMASK.asv 19KB
ROIselection.asv 4KB
Doublefoci3D.m 18KB
Postnatal Development of Homer1a in the Rat Hippocampus.pdf 962KB
LoadImage.m 5KB
NDPrunDouble2D.m 16KB
NDPrunDouble2D_wMASK.m 16KB
TxRedfoci2D.m 3KB
NDPrunFITC2D_wMASK.m 9KB
NDPRead.dll 2.23MB
NDPrunDouble2D_wMASK.asv 16KB
NDPrunDouble2D.asv 16KB
AdjustBrightness.fig 2KB
AdjustBrightness.m 4KB
NDPrunFITC2D_wMASK.asv 9KB
Findnnpair2.m 853B
README.md 3KB
FITCfoci2D_wMASK.asv 11KB
AdjustColorBalance.fig 3KB
IEGfoci.m 8KB
TxRedfoci2D.asv 3KB
Doublefoci3D_wMASK.m 20KB
Findnearest.m 774B
AdjustColorBalance.asv 6KB
PathChange.asv 267B
NDPrunFITC2D.m 8KB
ROIselection.m 4KB
FITCfoci2D.m 10KB
NDPrunFITC2D.asv 8KB
FITCfoci2D_wMASK.m 11KB
AdjustColorBalance.m 7KB
Doublefoci3D.asv 18KB
LucyNDP.exe 623KB
PathChange.m 419B
Findnnpair.m 932B
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