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基本粒子群代码matlab-cluster_fit:cluster_fit
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2021-06-16
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基本粒子群代码matlab Python 中的最大似然 该项目是接受/拒绝神经尖峰训练的最大似然模型的 Matlab 代码的翻译。 笔记 这个项目是一个 WIP。 入门 在本地克隆 repo。 先决条件 numpy scipy pyswarm 数据格式化 尖峰数据目前预计为 json 格式的数组,维度为 NumberOfCells X MaxTrials,尖峰以毫秒为单位。 数据处理代码要求每个单元一个文件,位于名为“spikes”的子目录中。 除了峰值之外,还必须创建“number_of_trials.json”来表示每个单元格存在多少次试验。 目前支持的补充信息: 文件“conditions.json”,包括每个单元格和试验的整数标签。 文件“spike_info.json”,一个 json 序列化的 dict,包含毫秒分辨率(例如动物位置)的标记信息。 这些文件的示例将在 /examples 中提供。 用法 在 /examples 中有一个示例脚本,它通过一个示例模型执行完整的分析例程,但是下面概述了一些基本用法。 必须初始化两个必需类的实例: DataProcessor(pat
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