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matlab代码绿颜色表示-cellsegmention:创建这个项目是为了提供一个医学应用程序,可以处理显微镜拍摄的细胞图像并...
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2021-06-03
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matlab代码绿颜色表示细胞分割 创建该项目是为了提供一种医学应用程序,该应用程序可以处理显微镜拍摄的细胞图像并计算细胞的平均强度。 目录 要求/环境 Python (>= 3.7) Python 开发环境,例如 Anaconda Navigator Matlab 运行时 9.8 创建python环境的最快方法是使用requirements.txt文件创建它,其中包含所有必要的具有适当版本的包。 该应用程序将 Segmentify 包作为插件添加到 Napari 多维图像查看器中。 但是,包中存在一个需要手动修复的错误。 找到 Segmentify setup.py的代码。 删除要使用requirements.txt的部分。 (第 7-14 行;第 45 行)。 使用 Converter 和 Segmentify 使用以下命令从终端启动 CziToPng.py: $ python CziToPng.py 在出现的窗口中,单击浏览按钮。 然后会出现一个弹出窗口,在这里您需要选择要转换的带有 czi 扩展名的文件。 然后点击convert按钮,创建扩展名为.png的文件,启动segmen
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cellsegmention-main.zip (29个子文件)
cellsegmention-main
CZIfiles
Snap-5927.czi 5.56MB
Snap-1622.czi 5.56MB
Snap-1772.czi 5.76MB
Snap-1787.czi 5.56MB
Snap-1603.czi 5.56MB
Snap-2049.czi 5.56MB
Snap-1634.czi 5.56MB
Snap-5928.czi 5.56MB
Snap-5898.czi 5.56MB
Snap-3041.czi 5.56MB
requirements.txt 2KB
README.md 3KB
Intensity
splash.png 31KB
Intensity.exe 2.32MB
Example
Snap-1772gb.png 1.22MB
Snap-1772seg.png 61KB
readme.txt 1KB
CziToPng.py 2KB
sejt_projekt_v3.m 8KB
figs
ResultChart.png 17KB
GreenChannelFig.png 40KB
SegmentifiedFig.png 40KB
ResultFig.png 102KB
PythonCommand.png 14KB
NapariSegmention.png 183KB
CziFileConverter.png 4KB
CziFileFormat.png 88KB
SegmentifiedFig2.png 39KB
Napari.png 114KB
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