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200704上海交大-侯佳林-环境微生物-Microbiome中文推送-详细版1
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微生物群落在深海热液硫化烟囱体由活跃转换为非活跃状态过程中的演替模式Microbial succession during the transition fro
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微生物群落在深海热液硫化烟囱体由活跃转换为非活跃状
态过程中的演替模式
Microbial succession during the transition from active to inactive stages of deep-
sea hydrothermal vent sulfide chimneys
期刊:Microbiome [IF 11.607]
发表日期:2020 年 6 月 30 日
DOI: https://doi.org/10.1186/s40168-020-00851-8
原 位 链 接 : https://microbiomejournal.biomedcentral.com/articles/10.1186/s40168-020-
00851-8
通讯作者:王风平
1,4,5
,肖湘
1,5
第一作者:侯佳林
1
合作 作者 : Stefan M. Sievert
2
,王 寅炤
1
,Jeff S. Seewald
3
,Vengadesh Perumal
Natarajan
1
主要单位:
1
中国,上海交通大学,生命科学技术学院,微生物代谢国家重点实验室,代谢发育科学国
际联合实验室
2
美国,Woods Hole 海洋研究所,生物系
3
美国,Woods Hole 海洋研究所,海洋化学与地化系
4
中国,上海交通大学,海洋学院
5
中国,南方海洋科学与工程广东省实验室(珠海)
摘要
深海热液喷口是由化能自养微生物维持的生态系统,具有极高的生产力和生物多样性。
喷发超高温热液的硫化烟囱体是该生态系统的典型代表性特征。之前已有研究关注活跃烟囱
体和熄灭时间长达千年的非活跃烟囱体中的微生物类群,但是对短期内熄灭的烟囱体却鲜有
报道,此外我们对于微生物群落在烟囱体由活跃状态转换至非活跃状态过程中的演替模式也
了解甚少。在本研究中,我们基于宏基因组学技术对两个来自东太平洋 9°-10°N 热液区域的
硫化烟囱体样本进行了全面的比较分析,其中 L-vent 烟囱体处于活跃喷发状态,而另一个
非活跃的 M-vent 烟囱体在大约 7 年之前已确认熄灭。来自全长 16S rRNA 基因和 173 个高
质量宏基因组拼接基因组(Metagenome-Assembled Genome, MAG)的证据显示,具有
反硝化潜能的硫/氢气氧化 Campylobacteria 和 Aquificae 作为初级生产者在活跃的 L-vent
烟囱体中占据主导地位,它们通过还原性三羧酸循环途径(rTCA)进行碳固定。而在近期
熄灭的 M-vent 烟囱体中,异养细菌如 Delta-/Beta-/Alphaproteobacteria 和 Bacteroidetes
处于优势地位,Gammaproteobacteria 被推测可以通过耦合金属硫化物/铁的氧化和硝酸
盐还原过程产生能量,并利用卡尔文循环(CBB)进行碳固定。进一步的分析还显示一支
具有独特系统发育地位的 Nitrospirae 具有耦合金属硫化物氧化和氧气/亚硝酸盐/硫酸盐还
原的潜能,更重要的是它们很可能可以作为一种标志微生物指示其所栖息的烟囱体正处于
熄灭后的早期阶段。
主要结果
表 1 活跃 L-vent 与短期非活跃 M-vent 烟囱体所喷发热液的地化特征
活跃的 L-vent 与短期非活跃的 M-vent 所喷发的热液具有显著差异的温度和化学组成,
其中 L-vent 所喷发的热液高达 231℃,富含大量的氢气和溶解态硫化物(分别为 6.3 和
0.83 mM),而从非活跃的 M-vent 所喷发的热液仅有 35℃,且溶解态硫化物仅有 0.00042
mM,氢气浓度低于检测极限。
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