基于数据挖掘比较慢性阻塞性肺疾病模型动物易感基因.pdf

本文的研究目的在于分析并比较用于慢性阻塞性肺疾病（COPD，简称慢阻肺）研究的常见动物模型中易感基因的差异，以便于优化选择更适合的实验动物模型。慢阻肺是一种以慢性呼吸道症状和气流受限为特征的疾病，是全球第四大死因，其发病机制复杂，涉及遗传和环境等多种因素。 在研究方法上，本文采用了生物信息学技术，在大鼠基因组数据库（RGD）中检索了人类、小鼠、大鼠等物种的基因组学数据，并进行了易感基因富集分析。利用Ensembl基因组数据库比较了不同物种间基因的异同，从而通过多源文本挖掘系统PolySearch2，挖掘了与慢阻肺相关的易感基因文献。通过这一系列方法，研究者得以分析不同物种在慢阻肺的疾病模型上可能存在的相似性和差异性。 研究结果显示，在人类、小鼠、大鼠这三种物种中，慢阻肺的易感基因数目十分接近。进一步地，在KEGG通路、生物表型、分子功能方面，这些物种之间也显示出较高的相似度。此外，文献中已经发表的有关慢阻肺易感基因的研究中，Z分数超过8.00的基因共有14个，这些基因被认为与慢阻肺的发病机制高度相关。 这些发现提示，尽管人类、小鼠和大鼠在基因层面存在相似性，并且在研究慢阻肺的发病机制上，这些物种都具有一定的适用性，但它们之间也存在基因的差异性，这可能影响到动物模型在模拟人类疾病时的准确性和适用性。因此，了解这些差异对于选择合适的模型进行相关研究至关重要。 在研究中，作者还特别指出，不同的动物模型在模拟慢阻肺疾病特征方面，如慢性肺部炎症细胞浸润、呼吸道重塑、肺气肿和肺功能受损等，表现出的临床差异较大。因此，通过基因差异的深入研究，有助于选择更合适的模型动物。 此外，本文还探讨了多源文本挖掘系统PolySearch2在易感基因挖掘中的应用。PolySearch2系统能够提取和分析人类疾病、基因、突变、药物、代谢物等之间的文本派生关系，从而为研究者提供了一个强有力的工具来分析和比较不同物种间的易感基因。 总结来说，本文通过对常见慢阻肺动物模型易感基因的比较研究，发现人类、小鼠和大鼠在慢阻肺的相关疾病、信号通路及作用靶点方面存在相似性和差异性。这些发现有助于优化选择更合适的研究模型，对慢阻肺的深入研究具有重要的参考价值。同时，该研究也展示了数据挖掘技术在疾病模型基因分析中的应用，为未来类似研究提供了一种有效的方法论参考。