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用CLUSTAL和MEGA做系统发生树PPT学习教案.pptx
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此款软件拥有phylogeny、User Tree、selection、rates、Clocks等多种功能,比Blast、Clustal软件强。序列比对、进化树、进化数据矩阵的性能十分完美,用过之后你会觉得真的很好的!
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用于蛋白质序列比对,包括同源性性分析、进化树构建;并可交互生成图
多序列比对 clustal X1.81
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clustal多序列比对汉化版
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一个很不错的DNA序列分析软件,集序列比对、进化树构建于一身。
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Clustal X为进行多重序列和轮廓比对和分析结果提供一个整体的环境。 序列将显示屏幕的窗口中。采用多色彩的模式可以在比对中加亮保守区的特征。窗口上面的下拉菜单可让你选择传统多重比对和轮廓比对需要的所有选项。...
phyloweb:Web应用程序,使用登录号作为输入并使用RAxML进行树推断来推断系统树
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这分3个步骤执行: 使用Entrez从NCBI服务器检索序列使用Clustal Omega或MAFFT进行多序列比对使用RAxML推断系统树先决条件: Python 3.x conda设定说明为了设置应用程序,您需要安装conda。 使用以下方法创建环境: ...
idwtree:使用系统发育树分配直系同源物-开源
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蛋白质 BLAST 分析可找到蛋白质的所有同源物; 然而,对于许多分析,重要的是识别不同物种中的直系同源物(例如源自... 使用比对构建系统发育树(例如使用 PHYLIP 包) 5. 使用 idwtree 将 BLAST 命中分配给直系同源组
生物信息多序列比对clustal
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介绍多序列比对工具clustalx *多序列比对的意义 *多序列比对的方法 *自动多序列比对的算法 *Clustalx的使用 *实例分析
序列比对现状
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分歧多于保守:人、小鼠、大鼠和猪中ktf家族进化分析* (2012年)
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为研究人、猪、大鼠、小鼠中klf家族的进化特征,笔者用Clustal X和MEGA,在线软件GSGD,K estimator r和PAML,在线软件MEME\MAST和InterProScan,PSORT Ⅱ分别构建进化亲缘关系树、分析基因结构、鉴定选择压力、...
ClustalX2.0
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IQ-TREE:高效的植物遗传学软件
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智商树 通过最大可能高效,通用的系统植物学软件介绍IQ-TREE软件是IQPNNI和 (因此称为IQ-TREE)的后继产品。 IQ-TREE受到快速增长的植物统计学数据的推动,从而导致需要能够处理大量数据并提供更复杂的序列进化模型...
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会计学
1
用
CLUST
AL
和
MEGA
做系统发生
树
CL
UST
AL
能读取的数
据格式
把所有的序列
放到一个文本文
档里,在序列名的
前面加上
#
号
第
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第
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