华为杯典型相关分析建模优秀论文

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参赛密码

（由组委会填写）

之间关联强度越强。利用 Bonferroni 校正，得到一个比较保守的结论，与患病

最相关的位点是 rs2273298。

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病关联最强的基因是 Gene102 和 Gene217。

关键词：遗传统计学，全基因组关联性分析(GWAS)，位点(SNPs)，卡方检

验，多元线性回归，典型相关分析

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3.2 问题二的分析 ............................................................................................ - 9 -

3.3 问题三的分析 .......................................................................................... - 10 -

3.4 问题四的分析 .......................................................................................... - 10 -

四. 问题一的模型建立与求解 .............................................................................. - 12 -

4.1 解题思路概述 .......................................................................................... - 12 -

4.2 转化映射表 .............................................................................................. - 12 -

4.3 流程图 ...................................................................................................... - 12 -

五. 问题二的模型建立与求解 .............................................................................. - 14 -

5.1 解题思路概述 .......................................................................................... - 14 -

5.2 数据预处理 .............................................................................................. - 14 -

5.3 利用卡方值来检验位点相似度 .............................................................. - 14 -

7.3 位点筛选 .................................................................................................. - 20 -

7.4 典型相关分析模型 .................................................................................. - 20 -

八. 总结与展望 ...................................................................................................... - 24 -

九. 参考文献 .......................................................................................................... - 26 -

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人体的每条染色体携带一个 DNA 分子，人的遗传密码由人体中的 DNA 携

带。DNA 是由分别带有 A、T、G、C 四种三项的脱氧核苷酸链接组成的双螺

病的发生。

Association Study, GWAS）是目前研究复杂性状的主要方法。GWAS 是应用人

类基因组中数以百万计的 SNPs 为标记进行病例对照关联分析，以期发现影响

复杂性疾病发生的遗传特征的一种新策略[8-12]。2005 年 Science 杂志首次报道

了年龄相关性视网膜黄斑变性 GWAS 结果，在医学界和遗传学界引起了极大的

轰动，此后陆续出现了有关冠心病、肥胖、2 型糖尿病、甘油三酯、精神分裂

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方式，以便进行数据分析。

表 1-1 染色体片段及位点信息

样本编号

样本健康状况