Network使用

"Network 使用详解" Network 软件是用于构建中介网络图的工具，它可以帮助用户更好更快地学习和分析序列数据。该软件包可以构建中介网络图（median network），这种网络图可包含所有最简约的树，且可以显示序列的信息，如同质性位点的位置、突变热点以及分辨单倍型类群等。在聚类簇中，节点之间的距离越近，它们的单倍型就越相近。 Network 软件包所采用的运算程序主要有 MJ（Median-Joining network）法和 RM（Reduced Median network）法。它根据各个人群在中介网络树的分组情况及其在各组中的分布频率，将这些人群的关系在一个二维图形上表示出来。在中介网络树上，可以让整个骨架以指定的序列为中心呈星型分布。根据这些星型的簇支，可以将所有序列分成若干组，从而明确其遗传、进化距离和系统发育关系等。 Network 软件包的最新版本为 NETW4109，下载网址为 www.fluxus-engineering.com。软件作者为剑桥大学的 Dr. Peter Forster。 在使用 Network 软件时，需要了解其输入数据的格式。Network 软件可以接受非重组 DNA 单倍型数据、RNA 或氨基酸序列、Multistate data、Binary data 等数据类型。对于不同类型的数据，需要使用不同的文件格式，例如 *.rdf、*.ami、*.tor 等。 在输入数据时，需要注意每个样本的名字的字符长度不能超过 6 个，每个样本序列长度（突变位点的总数目）不能超过，对于 Y-STR 数据，不能超过 100 个位点。如果某个样本的格式错误会导致 Network 程序运行出错误的结果，而不给任何提示。 在 Network 软件中，可以选择不同的数据类型，例如 DNA 核酸数据、Binary data、Amino acid data 等。可以通过“Data Entry”按钮弹出一个包括 5 个选项的下拉菜单，选择合适的数据类型，然后输入相应的数据信息。通过“Creat”按钮，可以设定序列的条数、突变位点的个数等信息，以及默认的权重登。 Network 软件包是用于构建中介网络图的工具，可以帮助用户更好更快地学习和分析序列数据。通过了解 Network 软件的输入数据格式和操作步骤，可以更好地使用该软件进行数据分析和研究。