没有合适的资源?快使用搜索试试~
我知道了~
文库首页
行业研究
行业报告
1_TCGA提取形成矩阵.R.r
1_TCGA提取形成矩阵.R.r
需积分: 9
0 下载量
57 浏览量
2022-11-27
19:22:16
上传
评论
收藏
1KB
R
举报
温馨提示
立即下载
开通VIP(低至0.43/天)
买1年送3月
1_TCGA提取形成矩阵.R.r
资源推荐
资源评论
TCGA_CHOL_maf.R.r
浏览:173
体细胞突变R代码。TCGA_CHOL_maf.R.r
TCGA免疫浸润_TCGA_perl脚本tcga_mRNA_merge.pl_perl整理tcga_
浏览:109
5星 · 资源好评率100%
TCGA(The Cancer Genome Atlas)项目是一个大规模的癌症基因组研究计划,旨在通过全面分析不同类型的肿瘤样本,揭示癌症的遗传和分子基础。这个压缩包包含的资源是针对TCGA数据进行免疫浸润分析的Perl脚本,这些...
TCGA-LIHC.GDC_phenotype.tsv.gz
浏览:34
TCGA-LIHC.GDC_phenotype.tsv.gz
Merge-putFilesToOneDir.zip_TCGA数据合并_mRNA merge.pl_mRNA_merge.pl_
浏览:165
5星 · 资源好评率100%
TCGA(The Cancer Genome Atlas)项目是一个大规模的癌症基因组研究计划,旨在通过全面分析不同癌症类型的基因组、转录组、表观基因组等多层次的分子数据,以揭示癌症的分子基础。在这个过程中,研究人员生成了大量...
基于GEO和TCGA联合分...F1对胃癌总体生存率的影响_王佳敏.caj
浏览:34
基于GEO和TCGA联合分...F1对胃癌总体生存率的影响_王佳敏.caj
2024年第十届全国大学生统计建模大赛数据存放_TCGA-CRC.zip
浏览:56
2024年第十届全国大学生统计建模大赛数据存放_TCGA-CRC
clinical_tcga:用于解析来自 TCGA 的临床元数据文件的库
浏览:94
临床_tcga 用于从 TCGA 解析元数据文件的库。例子需要两个文件作为输入:一个包含n 个样本 ID 的文件,另一个包含要提取的m 个临床特征; 和要使用的数据库(本地)。 还需要定义输出文件。 数据库应该是制表符分隔...
TCGA临床数据提取_perl提取tcga临床数据,perl读取临床数据报错
浏览:102
5星 · 资源好评率100%
在进行TCGA临床数据的提取时,程序员通常会使用编程语言如Perl,因为Perl具有强大的文本处理能力,适合处理大量的结构化和非结构化数据。Perl读取临床数据的常见步骤包括: 1. **数据下载**:首先,你需要从TCGA的...
TCGA简易下载工具.zip
浏览:90
TCGA(The Cancer Genome Atlas)是一项大规模的癌症基因组研究项目,旨在通过全面分析不同癌症类型的基因组、转录组、表观基因组等多维度数据,揭示癌症的分子基础和潜在治疗靶点。这个“TCGA简易下载工具”是为了...
TCGA临床数据提取
浏览:40
5星 · 资源好评率100%
R语言的XML包提供了一系列用于解析和操作XML文档的函数,极大地简化了从XML文件中提取数据的过程。然而,正如文中指出的那样,如果使用的XML处理程序无法获取到最新更新的数据,那么提取到的生存时间就可能是错误的...
TCGA数据库使用教程.pdf
浏览:155
5星 · 资源好评率100%
此外,TCGA还提供了基因表达数据,这可以帮助研究者了解基因在肿瘤形成过程中的表达变化。通过比较肿瘤组织和正常组织的基因表达水平,可以识别出可能参与肿瘤发生和进展的关键基因。这些发现可能为开发新的药物靶点...
TCGA数据分析-差异表达.R.r
浏览:67
TCGA数据分析-差异表达.R.r
生物信息学概论——聚类分析TCGA-BRCA数据.zip
浏览:121
5星 · 资源好评率100%
利用R软件或其他数据分析语言,进行该数据的聚类分析。利用层次聚类,对该组数据样本按照基因表达水平进行聚类,看聚类效果如何。即是否能够按照基因表达水平,将病人进行分类。距离可以选择average。注,R中有相应...
Shiny_tcga_tsne:tSNE框架,用于TCGA和其他大型患者数据集的可视化和分析
浏览:22
《使用R语言Shiny_tcga_tsne框架进行大型患者数据集的tSNE可视化与分析》 在现代生物医学研究中,尤其是肿瘤基因组学领域,TCGA(The Cancer Genome Atlas)项目积累了海量的患者数据,包括基因表达、拷贝数变异、...
MergeList_Sq.zip_MergeList Sq_MergeList_Sq
浏览:22
1. **基于数组的合并**:如果线性表是以数组的形式存储,我们可以使用两个指针分别指向两个数组的起始位置,比较两个指针所指元素的大小,将较小的元素添加到结果数组中,并移动对应指针。这个过程持续到所有元素都...
新版TCGA数据整理,通过R语言实现TCGA数据整理
浏览:171
通过对上述文件内容的解析,我们了解到如何使用R语言结合相关包来实现TCGA数据的整理,创建表达矩阵,并根据需要选择不同的数据格式进行分析。这为深入挖掘TCGA数据提供了有效的途径,并可能进一步推动癌症治疗和...
pori_cbioportal:cBioportal适配器,用于在IPR中创建PORI报告
浏览:9
PORI c生物门 该库是一部分。 该python软件包使用IPR和GraphKB PORI适配器从cbioportal数据转储中创建PORI报告。 入门 通过点子安装 pip install pori_cbioportal 下载研究数据 研究数据应从cbioportal... acc_tcga
gdc_download_20180802_005928.tar_mRNAmerge_merge_mrna_Perl_
浏览:162
描述 "merge从TCGA数据库下载的 mRNA数据,并形成矩阵" 进一步明确了这个过程。TCGA(The Cancer Genome Atlas)是一个大型的公开数据库,包含了多种癌症类型的基因表达、表观遗传学、蛋白质组学等多维度的生物信息...
TCGA数据库挖掘.mp4
浏览:165
TCGA数据库挖掘.mp4
TCGA-LUAD-mRNA表达数据(TPM)-肺腺癌表达及临床数据集整理
浏览:165
5星 · 资源好评率100%
TCGA-LUAD-mRNA表达数据(TPM)-肺腺癌表达及临床数据集整理是一份重要的生物信息学资源,特别适用于癌症研究。这个数据集包含来自The Cancer Genome Atlas (TCGA)项目的肺腺癌(Lung Adenocarcinoma, LUAD)患者的...
EC_TCGA_vs_gnomAD
浏览:27
EC_TCGA_vs_gnomAD 用于生成以下各项的图形和表格的代码:Kondrashova O.&Shamsani J.等。 “肿瘤特征分析将遗传性癌症基因与子宫内膜癌的发展联系起来”,癌症(印刷中)
PSI_download_BLCA.zip
浏览:120
3. **TCGA数据的处理和分析**:学习如何解析和利用TCGA的原始数据,包括可变剪接矩阵,这可能涉及到R语言的Bioconductor包或其他生物信息学工具。 4. **统计和生物信息学方法**:掌握如何计算和解读PSI值,以及如何...
TCGA-KIRC-mRNA表达数据——肾透明细胞癌表达及临床数据集整理
浏览:163
5星 · 资源好评率100%
TCGA-KIRC数据集已经整理成LCPM格式,临床数据已经汇总整理。 LCPM格式即log2(CPM+1)格式,现在认为log2(TPM+1)和log2(FPKM+1)格式比较过时了。部分生信文章审稿人推荐使用此格式分析数据
TCGA数据分析.mp4
浏览:33
TCGA数据分析
TCGA癌症数据库介绍专题.ppt
浏览:16
"TCGA癌症数据库介绍专题" TCGA(The Cancer Genome Atlas)癌症数据库是一个由美国国家癌症研究所(National Cancer Institute)和国家人类基因组研究院(National Human Genome Research Institute)共同发起的...
TCGA癌症数据库介绍专题.pptx
浏览:111
"TCGA癌症数据库介绍专题" TCGA癌症数据库是美国国立卫生研究院(NIH)的一个大型癌症研究项目,旨在对 humanity 癌症进行深入研究和分析。该项目于2005年启动,旨在对人类癌症进行系统化、整体化的研究,以期更好...
傻瓜式快速下载TCGA数据(win x86版本)
浏览:140
TCGA(The Cancer Genome Atlas)项目是一个大型的国际科研合作项目,旨在通过全面分析多种癌症的基因组、转录组、表观基因组等多维度数据,深入理解癌症的分子基础,为疾病诊断、治疗和预后提供新的见解。...
TCGA-BLCA-mRNA表达数据(TPM)-膀胱癌表达及临床数据集整理
浏览:90
5星 · 资源好评率100%
标题中的“TCGA-BLCA-mRNA表达数据(TPM)-膀胱癌表达及临床数据集整理”指的是The Cancer Genome Atlas (TCGA)项目中关于膀胱癌(BLCA)的数据,具体聚焦于mRNA转录水平的表达数据,以Transcripts Per Million (TPM...
Unet 基于TCGA颅脑肿瘤MRI分割(提取有效数据+划分训练集、验证集)
浏览:68
数据中中包含了大量对图像分割没有意义的数据,因此这里对原始数据集进行有效数据的提取。并且将有效数据集再次进行训练集 + 测试集的划分 注:log 训练文件较大,为了方便上传,这里删去不重要的train结果
评论
收藏
内容反馈
立即下载
开通VIP(低至0.43/天)
买1年送3月
资源评论
资源反馈
评论星级较低,若资源使用遇到问题可联系上传者,3个工作日内问题未解决可申请退款~
联系上传者
评论
GXL0818
粉丝: 0
资源:
1
私信
上传资源 快速赚钱
我的内容管理
展开
我的资源
快来上传第一个资源
我的收益
登录查看自己的收益
我的积分
登录查看自己的积分
我的C币
登录后查看C币余额
我的收藏
我的下载
下载帮助
前往需求广场,查看用户热搜
最新资源
精品推荐-大型企业集团ERP数字化体系建设培训PPT大全.zip
Window控制台实现俄罗斯方块打包程序
纯CSS3简洁滑块范围数值输入特效.zip
flex布局mooc网项目演示
以赛讯为主题的项目开发方案APP.zip
Office365 命令式下载和安装工具
废弃 arc90 可读性书签的 Python 端口.zip
毕业设计背单词微信小程序.zip
Zulip API 的 Python 库 .zip
Zipline,一个 Pythonic 算法交易库.zip
资源上传下载、课程学习等过程中有任何疑问或建议,欢迎提出宝贵意见哦~我们会及时处理!
点击此处反馈
安全验证
文档复制为VIP权益,开通VIP直接复制
信息提交成功