TCGA数据分析.mp4

TCGA数据下载及全流程分析（更新中）

一、GDCRNATools包下载 首先下载R包 if (!requireNamespace...下载好之后运行，以COAD数据为例，下载： library(GDCRNATools) gdcRNADownload(project.id = TCGA-COADREAD, data.type = RNAseq, write.ma

TCGA-肺癌数据分析：来自TCGA数据集的肺癌数据分析项目-源码

TCGA肺癌数据分析 该数据分析项目已在密歇根大学的2020年秋季我的Stats 600回归分析课程中完成。 分析的数据包含肺癌患者的样本以及不同的临床因素及其基因组信息。 在此分析中，我想回答以下问题：哪些mRNA基因表达...

TCGA数据库挖掘.mp4

TCGA数据库挖掘.mp4

TCGA临床数据提取_perl提取tcga临床数据,perl读取临床数据报错

自己编写程序，对TCGA的临床信息进行整理和提取，便于做生存分析

TCGA临床数据提取

自己编写程序，对TCGA的临床信息进行整理和提取，便于做生存分析

TCGA简易下载工具.zip

该工具可以简化TCGA数据库的下载步骤，合并TCGA数据库中下载的文件挺不错的一个资源，亲测可用，如果需要的话，就赶紧来下载吧!!

基于Oncomine和TCGA数据挖掘分析MTERF2在胰腺癌中的表达及临床意义.pdf

基于Oncomine和TCGA数据挖掘分析MTERF2在胰腺癌中的表达及临床意义.pdf

TCGA的RNA-seq数据id转换

TCGA 的 RNA-seq 文件的 gene id 是 ENSEMBL 的 RNA id，使用的时候常常需要转化成 gene symbol。此文档介绍了id转换的方法

TCGA-KICH 癌症 CT 影像.torrent

TCGA – KICH 癌症 CT 影像是腺瘤和腺癌相关的数据集，其包含来自 113 人共 2325 个数据文件，该数据集旨在对癌症诊治过程进行全程数字化跟踪，并以数字档案的形式记录检查结果、处方和疗效。 该数据集由 GDC Data ...

tcga官方下载工具

tcga官方下载工具 最近服务器不稳定 有时候下载很慢 如果很难下载可以试试从这里下载

TCGA简易下载工具

该工具可以简化TCGA数据库的下载步骤，合并TCGA数据库中下载的文件

癌症CT影像数据【Kaggle数据】.txt

本数据集是一个癌症CT图像数据，包括69位不同的患者的475个病例的中等规模的CT影像和患者年龄。该数据是 TCGA-LUAD 肺癌CT影像数据库的一部分。

典型相关分析matlab实现代码-TCGA-Survival:TCGA生存

典型相关分析matlab实现代码提取TCGA数据以进行生存分析的脚本。 有关与癌症有关的更多说明，请参见 资料说明 可通过，获取公开数据。 首先，安装BiocManager::install("CNTools") ，克隆存储库git clone ...

基于TCGA数据挖掘的乳腺癌预后相关mRNA研究.pdf

基于TCGA数据挖掘的乳腺癌预后相关mRNA研究.pdf

基于TCGA数据挖掘筛选肺鳞癌预后相关lncRNA分子标签.pdf

基于TCGA数据挖掘筛选肺鳞癌预后相关lncRNA分子标签.pdf

典型相关分析matlab实现代码-TCGAsurvival:分析TCGA数据的脚本

典型相关分析matlab实现代码提取TCGA数据以进行生存分析的脚本。 有关与癌症有关的更多说明，请参见 资料说明 可通过，获取公开数据。 首先，安装BiocManager::install("CNTools") ，克隆存储库git clone ...

TCGA.ql:TCGA 的原型查询 DSL-源码

TCGA.ql 是一个原型查询构建器和 DSL，用于在 TCGA 的开放访问 HTTP 存储库中查找数据文件，作为的组件构建。 用法 首先，创建一个查询对象： // Using the TCGA.ql getter query = TCGA.ql; // Alternately, use...

clinical_tcga:用于解析来自 TCGA 的临床元数据文件的库-源码

用于从 TCGA 解析元数据文件的库。 例子 需要两个文件作为输入：一个包含n 个样本 ID 的文件，另一个包含要提取的m 个临床特征； 和要使用的数据库（本地）。 还需要定义输出文件。 数据库应该是制表符分隔的文件。...

Roadmap:Scraper 将 TCGA 的开放访问 HTTP 站点中列出的文件索引为 RDF-源码

TCGA 路线图 Scraper 将列出的文件索引为 RDF。 架构 TCGA 中用于表示资源的模式可作为。 如下所用，前缀tcga表示... 数据类型对应目录结构： tcgaRoot:DiseaseStudy/CenterType/CenterDomain/Platform/