ClusterE系统操作手册资源-CSDN文库

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目录
第 1 章  前 言............................................................................................................................................1
第 2 章 使用环境要求...............................................................................................................................3
.1  JAVA 虚拟机环境..............................................................................................................................3
.2  系统环境要求..................................................................................................................................4
第 3 章  软件架构......................................................................................................................................5
第 4 章  软件的使用..................................................................................................................................6
.3  软件运行界面..................................................................................................................................6
.4  软件菜单功能介绍..........................................................................................................................7
.5  系统数据信息的读取......................................................................................................................9
.6  系统数据信息分析........................................................................................................................15
.7  系统可视化展示功能描述............................................................................................................15
.8  系统数据信息分析结果保存........................................................................................................18
.9  系统数据信息分析结果评估........................................................................................................19
.10  系统数据信息分析算法的有效性检验......................................................................................41
.11  系统蛋白质功能注释信息查看...................................................................................................44
.12  系统中插件信息查看..................................................................................................................46
.13  系统帮助信息查看......................................................................................................................48
第 5 章 基于 CLUSTERE 系统插件的开发..........................................................................................51
.14  系统提供插件开发接口介绍......................................................................................................51
.15  插件开发环境搭建......................................................................................................................51
.16  数据信息分析算法类插件开发..................................................................................................54
.17  分析结果评估方法类插件开发..................................................................................................61
.18  本章小结......................................................................................................................................66
第 6 章  常见问题....................................................................................................................................67
第1章 前 言
蛋白质网络聚类算法分析平台 ClusterE1.0 是中南大学信息科学与工程学院生物信息研
究组独立开发的生物信息分析平台。
蛋白质网络聚类是识别功能模块的重要手段，不仅有利于理解生物系统的组织结构，
对预测蛋白质功能也具有重要的意义。针对目前蛋白质网络聚类算法缺乏有效分析软件的
事实，本项目设计并实现了一个新的蛋白质网络聚类算法分析平台 ClusterE。该平台实现
了查全率、查准率、敏感性、特异性、功能富集分析等聚类评估方法，并且集成了 FAG-
     
 