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第一章 CANOCO 简介
一 软件功能
Canoco for Windows 是新一代的 CANOCO 软件，是生态学应用软件中用于约束与非约
束排序的最流行工具。Canoco for Windows 整合了排序以及回归和排列方法学，以便得到健
全的生态数据统计模型。Canoco for Windows 包括线性和曲线单峰方法。使用 Canoco for
Windows 进行排序，能够洞察：
● 生物群落结构
● 植物与动物群落以及它们的环境之间的联系
● 一个对环境和(或)其生物群落的假设冲击所能造成的影响
● 在生物群落上进行的复杂生态学和生态毒理学实验的相关处理所能造成的影响
一个排序被计算出来后，排序图可以立即显示在显示器上。Canoco 具体独特的能力，可
以说明用协变量表示的背景变异，而用它的扩展工具来进行排列测试，包括测试的互动效果。
这些独特的特性使得 Canoco for Windows 能特别有效的解决应用研究方面的问题。
二 软件模块
The Canoco for Windows 软件包主要包含以下几个模块：
● Canoco for Windows：软件包的核心，用来指定要分析的数据和排序模型，排序方法
以及分析结果的查看等基本操作命令均被集中在该模块的对话框中
● WcanoImp：将以电子表格形式（Excel 等）保存的外部数据转化为 CANOCO 识别的
形式
●
CanoDraw 4.0 for Windows：用来绘制各种类型的排序图，同时也可以生成多种等值
线和回归模型图，并进一步深层次发掘排序结果，该模块可以直接从主程序界面工
具栏激活
● CanoMerge：合并 Canoco 识别的 dta 类型数据文件，并可以将数据文件以带制表分
隔符的文本形式输出（基本常用统计软件均兼容该类型文件），同时该模块具有滤掉
低频率物种的功能
● PrCoord：对特定数据集进行主坐标分析以及冗余分析
三 统计方法
这里只简要阐述 CANOCO 具有的统计分析方法，不做赘述，后面章节将详细论述操作
步骤。主要分析方法有以下四大类型：
A 非约束型排序方法（Unconstrained ordination methods）
主成分分析 （Principal components analysis，PCA）
对应分析 （Correspondence analysis，CA）
降趋对应分析（去趋势对应分析）（Detrended correspondence analysis，DCA）
主坐标分析 （Principal coordinates analysis，PCoA 或 PCO）
B 约束性排序方法（Constrained ordination methods）
冗余分析 （Redundancy analysis，RDA）
典型对应分析（典范对应分析）（Canonical correspondence analysis，CCA）
降趋典范对应分析 （Detrended canonical correspondence analysis，DCCA）
典型变量分析 （Canonical variate analysis，CVA）
distance-based redundancy analysis (db-RDA)
C 非约束性偏分析法（Partial methods of unconstrained ordination）
partial PCA、 partial CA、 partial DCA
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