基因序列筛选

matlab实现的基因序列的预处理，筛选，重排列，规定格式输出 这段程序的主要作用是，从一个基因库中，查找到我们的目的基因，然后将该目的基因连带其后面的核苷酸序列一起按照fasta格式输出。为了方便后面的靶基因的预测，可以减少很大的工作量。本人从事生物信息分析很多年，...

评级：0 浏览量：320 收藏量：0 资源大小：962B 上传时间：2014-04-08

凡纳滨对虾基因组fosmid文库的构建及钙离子通道基因的筛选 (2010年) 根据和果蝇钙离子通道基因同源的凡纳滨对虾EST序列设计引物，对文库进行了PCR筛选，得到1个阳性克隆，测序结果显示该克隆包含有钙离子通道基因。研究结果为凡纳滨对虾的基因克隆和分子选育等研究奠定了基础。

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不同中医治法选择性下调大鼠肝癌高表达基因完整表达序列的筛选 不同中医治法选择性下调大鼠肝癌高表达基因完整表达序列的筛选，梁超，方肇勤，目的：为对若干肝癌高表达基因进行进一步研究，克隆各基因的完整表达序列。方法：DEN诱发大鼠肝癌后经不同中医治法治疗，肝癌组织

评级：0 浏览量：61 收藏量：0 资源大小：292KB 上传时间：2020-01-06

TRTools:用于全基因组串联重复序列分析的工具包 TR工具TRTools包括各种实用程序，可用于筛选，质量控制和分析在从下一代测序中进行基因分型的下游的串联重复序列。 它支持多种最新的基因分型工具（见下文）。 请参阅完整文档和示例。 如果您在工作中使用TRTools，...

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猪生长激素(PGH)基因全序列扩增及序列分析 (2002年) 筛选了一对扩增PGH基因全序列的引物,用PCR法成功地扩增了PGH基因全序列,并对扩增产物进行了序列多态性分析。结果表明,与Vize等1987年公布的序列存在57bp的差异,同源性为97 .19％;5个外显子间有3 by的不同,同源性达99...

评级：0 浏览量：51 收藏量：0 资源大小：265KB 上传时间：2021-05-17

树干毕赤酵母基因组文库的构建及纤维二糖酶基因的筛选 (2013年) 树干毕赤酵母染色体基因为15 441 179 bp，该文库覆盖1.08倍树干毕赤酵母染色体基因，筛选出任一基因或序列的概率为97％。提取文库中的质粒醋酸锂法转化酿酒酵母 W303-1A，涂布于纤维二糖为唯一碳源的平板，通过纤维...

评级：0 浏览量：53 收藏量：0 资源大小：359KB 上传时间：2021-05-24

大鼠CRMP1基因siRNA的筛选 (2010年) 目的:筛选有效抑制大鼠 CRMP1基因表达的 siRNA序列。方法:化学合成3对针对大鼠 CRMP1基因 的特异性 siRNA,用脂质转染胺( lipofectamine) LTX转染大鼠海马神经元,通过流式细胞仪检测转染效率,使用 RT-PCR与实时 PCR...

评级：0 浏览量：41 收藏量：0 资源大小：750KB 上传时间：2021-04-27

显齿蛇葡萄实时荧光定量PCR内参基因的筛选与验证 显齿蛇葡萄实时荧光定量PCR内参基因的筛选与验证，张玉文，伊恒杰，采用RT-PCR方法，从显齿蛇葡萄中克隆得到Actin、18s-rRNA、GAPDH、α-tubulin、β-tubulin和UBQ 6个候选内参基因的编码区或部分序列。应用实时荧�

评级：0 浏览量：254 收藏量：0 资源大小：694KB 上传时间：2020-02-12

木奈果实POD基因EST序列的分离与表达研究 木奈果实POD基因EST序列的分离与表达研究，王玉珍，陈桂信，采用稀释池PCR法筛选木奈果实均一化全长cDNA文库，获得木奈果实POD基因的EST（PsPOD），该序列长度1143 bp，其中3'UTR为407 bp，ORF为708 bp，编

评级：0 浏览量：76 收藏量：0 资源大小：421KB 上传时间：2020-02-11

凡纳滨对虾线粒体DNA CO I基因片段序列 (2005年) 以相应引物对凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)线粒体DNA细胞色素氧化酶I亚基基因(mtDNA CO I)进行 PCR扩增，经过基因重组、转化、克隆、筛选、DNA测序，得到709 bp的碱基片段．碱基组成A、C、G、T含量分别为198 bp...

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植物乳杆菌食品级基因工程受体菌的筛选 植物乳杆菌食品级基因工程受体菌的筛选，范硕，田洪涛，从韩国泡菜中分离出五株乳酸菌，经形态学、生理生化鉴定和16S rDNA全序列分析，将测序结果在GenBank上进行BLAST比对，构建系统发育树，�

评级：0 浏览量：183 收藏量：0 资源大小：476KB 上传时间：2020-03-04

日本囊对虾线粒体DNA CO I基因片段序列分析 (2005年) 以相应引物对日本囊对虾(Marsupenaeus japonicus)线粒体DNA细胞色素氧化酶I亚基基因(mtDNA CO I)进行PCR扩增，经过基因重组、转化、克隆、筛选、DNA测序，得到709 bp的碱基片断．碱基组成A、C、G、T含量分别为196 bp...

评级：0 浏览量：63 收藏量：0 资源大小：401KB 上传时间：2021-06-14

利用KS基因筛选Ⅱ型聚酮类化合物产生菌的方法研究 (2010年) 克隆并测序获得16条KS基因序列,进行BLAST同源性比对,与GenBank中已知的KS基因序列的相似度在89%～99%之间。提交GenBank,获得的各菌株KS基因登录号为FJ620885～FJ620889,FJ620892,FJ878801～FJ878810。抑菌实验表明,...

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大腹圆蛛拖丝蛋白基因3′端克隆和序列分析 (2008年) 用PCR(Polymerase Chain Reaction)技术从大腹圆蛛主壶腹腺组织的基因组DNA和RNA中分别扩增获得编码拖丝蛋白基因的3′端基因序列，克隆PCR产物到pDrive载体，经PCR、限制性酶切筛选和序列分析后证明获得了蜘蛛拖丝...

评级：0 浏览量：45 收藏量：0 资源大小：285KB 上传时间：2021-04-25

秀丽线虫基因敲除突变库中see-10突变种系的筛选 (2010年) 从秀丽隐杆线虫(Caenorhabditis elegans)的基因突变库中筛选出目的基因的突变种...根据sec-10基因序列设计多套针对不同靶点的含干扰引物的巢式引物,通过凝胶电泳正确判断扩增产物的特异性和干扰引物对长片段产物的抑制

评级：0 浏览量：59 收藏量：0 资源大小：319KB 上传时间：2021-04-28

家蚕DGCR6-Like蛋白基因的序列分析和原核表达 家蚕DGCR6-Like蛋白基因的序列分析和原核表达，朱安平，陈剑清，从本实验室构建的家蚕cDNA文库中筛选得到一新的cDNA，经生物信息学分析发现其具有DGCR6保守结构域，我们将其命名为家蚕BmDGCR6。家蚕BmDG

评级：0 浏览量：68 收藏量：0 资源大小：346KB 上传时间：2020-01-04

人胎盘TRAIL基因的cDNA克隆及序列测定 (2005年) 根据GeneBank(I337518)中TRAIL肿瘤坏死因子相关的凋亡诱导配体）的cDNA序列，设计扩增引物。...筛选阳性克隆菌，酶切鉴定并进行序列测定。结果表明，本试验成功地克隆了TRAIL基因的1 039 by全长cDNA。

评级：0 浏览量：26 收藏量：0 资源大小：184KB 上传时间：2021-06-18

植物乳杆菌ZJ316黏附蛋白基因的克隆及序列分析 植物乳杆菌ZJ316黏附蛋白基因的克隆及序列分析 ，王嘉雯，王净净，本研究以本实验室保存的从婴儿粪便中筛选得到的一株产细菌素的植物乳杆菌（Lactobacillus plantarum ZJ316）为研究对象。采用同源克隆法，�

评级：0 浏览量：69 收藏量：0 资源大小：445KB 上传时间：2020-03-05

PCR快速筛选棉纤维cDNA文库分离全长cDNA序列 (2005年) 建立了一种利用PCR-96孔板法快速筛选棉纤维cDNA噬菌体文库,分离全长基因序列的技术体系.首先根据已知EST片段设计一至两对特异PCR引物,通过在96孔滴定板上逐级稀释cDNA文库,利用特异引物以及特异引物与通用引物组合...

评级：0 浏览量：53 收藏量：0 资源大小：307KB 上传时间：2021-06-14

人核蛋白P68 cDNA基因克隆及全序列测定 (1993年) 靠人工合成4个混合寡聚核苷酸探针,从一个人胎盘λgt11 cDNA库中筛选到含有p68 cDNA基因的阳性噬菌斑。经次克隆得到含p68 cDNA基因的pBRB_(T7)―p68质粒。用末端终止法对此cDNA基因进行了全序列测定。分析结果证明...

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传染性喉气管炎病毒河南株gB基因的克隆与序列分析 (2007年) 根据传染性喉气管炎病毒（ILTV）gB基因的核苷酸序列，设计、合成I对引物，应用PCR扩增鸡ILTV河南株（ILTV-CG）gB基因。将扩增片段克隆人pGEM-T Easy载体后，经蓝白斑筛选，菌液PCR和酶切鉴定为阳性的重组菌进行测序...

评级：0 浏览量：41 收藏量：0 资源大小：981KB 上传时间：2021-05-23

Zfx基因慢病毒RNA干扰载体构建及有效靶点筛选 Zfx基因慢病毒RNA干扰载体构建及有效靶点筛选，饶竞，赵洪洋，本研究为了构建人Zfx基因慢病毒RNA干扰载体，筛选干扰效率最高的有效靶点。根据Zfx基因（NM_003410）序列，利用软件设计合成Zfx基因的特

评级：0 浏览量：75 收藏量：0 资源大小：429KB 上传时间：2020-01-05

生物转化产d-伪麻黄碱菌株的筛选及其关键酶基因的验证 (2013年) 利用GenBank和UniProt数据库比对MorganellamorganiiJ8拨基还原酶基因和氨基酸序列,以同源性为依据,结合高效液相色谱(HPLC)检测验证,筛选出5株同样具有转化1苯基2甲氨基丙酮(MAK)产d伪麻黄碱功能的菌株。选取其中1株...

评级：0 浏览量：39 收藏量：0 资源大小：1.01MB 上传时间：2021-05-13

柳穿鱼自然群体中不同cpDNA片段的序列分析与筛选研究 (2013年) 植物叶绿体基因组DNA（cpDNA）的非编码序列是研究植物分子系统发育、群体遗传学和建立植物DNA条形码（Barcodes）的重要工具.为了筛选适宜的cpDNA片段研究柳穿鱼（Linaria vulgaris）遗传多样性，本研究对柳穿鱼4个...

评级：0 浏览量：39 收藏量：0 资源大小：1.72MB 上传时间：2021-04-26

乳酸乳球菌nisin抗性基因的克隆及作为筛选标记的研究 (2008年) 根据形态观察，生理生化特性和16S rDNA基因序列比对被鉴定为乳酸乳球菌。根据已报道nisin抗性基因设计引物，分别以这5株菌的染色体和质粒DNA为模板进行PCR扩增，结果从1株抗性菌株的染色体上得到目的基因产物。通过...

评级：0 浏览量：47 收藏量：0 资源大小：826KB 上传时间：2021-05-28

IBV单链抗体的筛选及其互补决定区序列变异分析倡 (2011年) 利用重组链延伸反应(SOE-PCR) ,将linker与VH和VL基因相连构建鸡scFv 基因,并将其克隆到原核表达载体pOPE101-XP中,构建重组质粒并转入大肠杆菌表达,间接ELISA筛选原核表达的抗IBV scFv的阳性克隆,对其测序后进行...

评级：0 浏览量：39 收藏量：0 资源大小：2.81MB 上传时间：2021-06-18

猪传染性胃肠炎病毒纤突蛋白全基因的克隆与序列分析 (2007年) TGEV）TSX毒株纤突蛋白（spike protein，S）基因全长cDNA序列，分离纯化PCR产物，连接到pGEM-T载体，转化大肠杆菌DH5а，筛选阳性克隆pGEM-S，并对其进行酶切鉴定和测序，对测序结果及推导氨基酸序列进行同源性分析...

评级：0 浏览量：41 收藏量：0 资源大小：421KB 上传时间：2021-06-16

应用酵母单杂交技术筛选BmNPV多角体基因启动子结合蛋白 应用酵母单杂交技术筛选BmNPV多角体基因启动子结合蛋白，李佳，高珍，本研究以家蚕杆状病毒（BmNPV）为研究对象，筛选其多角体基因高效转录过程中与启动子序列相互作用的结合蛋白。通过提取感染BmNPV第5�

评级：0 浏览量：107 收藏量：0 资源大小：914KB 上传时间：2020-01-30

黑曲霉（Aspergillus niger）三磷酸甘油醛脱氢酶基因(GPD)的序列测定与同源性分析 (1999年) pANGPD是用构巢曲霉GPD基因片段为探针0490-6756从黑曲霉墓因组文库中筛选到的一个二磷酸甘油醛脱氢酶荃因（GPD）阳性克隆0490-6756 作者对该阳性克隆进行了亚克隆和序列测定0490-6756结果表明：基因片段总长2441个...

评级：0 浏览量：35 收藏量：0 资源大小：321KB 上传时间：2021-05-08

多环芳烃降解菌的筛选及其降解性能的强化 为提高煤化工废水生化处理系统中微生物对多环芳烃降解效率,从生化出水中筛选了一株以菲为唯一碳源的高效降解菌,并进行了16Sr DNA基因序列鉴定。通过考察降解菌的生理生化特性和粘附特性,确定了降解菌的最适生长条件,...

评级：0 浏览量：182 收藏量：0 资源大小：1.5MB 上传时间：2020-04-17

昆虫-病毒关系：通过信息学筛选 在这里，我们描述了一种基于信息学的方法，该方法使用病毒基因组序列的比较来识别可能专门参与该过程的候选基因。 我们假设这些基因应该满足两个基本标准，即它们应该 (i) 存在于感染昆虫的病毒家族成员中，但不存在...

评级：0 浏览量：74 收藏量：0 资源大小：366KB 上传时间：2021-06-29

Genrich:检测基因组富集的位点 筛选选项未配对的比对 ATAC序列模式 调峰参数 各种各样的 完整的分析示例 警告讯息 计算要求 接触 介绍 Genrich是基因组富集测定（例如ChIP-seq，ATAC-seq）的高峰调用者。 它分析测定后生成的比对文件，并生成详细...

评级：0 浏览量：151 收藏量：0 资源大小：111KB 上传时间：2021-05-05

农杆菌介导AtPCSl基因转化苜蓿 (2007年) 利用RT-PcR扩增拟南芥螯合肽合成酶（AtPCSI）基因全序列。进一步构建AtPCSl的植物表达载体pB I 121-AtPCSl，转化农杆菌EHA105；然后用转化的农杆菌EHA105以叶盘法侵染苜蓿甘农一号叶片，在50mg/L Kan的筛选压下，...

评级：0 浏览量：41 收藏量：0 资源大小：433KB 上传时间：2021-04-27

油菜原花色素合成途径基因的克隆及进展 (2012年) 分析了在油菜中已经克隆的部分原花色素合成途径基因与种皮颜色的关系,提出了如何利用 已经公开的油菜、白菜基因组序列通过筛选 BAC文库得到基因不同拷贝的全长序列的综合路径,列举了笔者运 用该方法已经克隆的部

评级：0 浏览量：67 收藏量：0 资源大小：255KB 上传时间：2021-06-14

表达相关的转录因子相互作用模式 转录因子通过与基因上游特定序列结合，调控着靶基因在特定的时间和空间以一定的强度表达．不同的转录因子之间通过多种方式相互组合，为这一调控过程提供了更多的可能．为了研究与表达相关的转录因子的调控模式，以GM...

评级：0 浏览量：290 收藏量：0 资源大小：1.56MB 上传时间：2021-03-07

玉米WRKY基因聚类分析 (2012年) 对其所翻译的氨基酸序列经比对和系统发生分析后，将该61个基因进行了分类，结果表明：该61个玉米WRKY转录因子中共有I类13个、Ⅱ类32个、Ⅲ类16个．聚类分析结果与该三类WRKY转录因子的进化关系相一致．对玉米WRKY...

评级：0 浏览量：138 收藏量：0 资源大小：376KB 上传时间：2021-05-13

鲤鱼IL8的克隆及序列分析* (2008年) 克隆（编码IL8的一段序列），对该基因进行DIG标记，对有丝分裂原刺激的鲤鱼外周血白细胞cDNA文库进行核酸杂交筛选，从0.8×104个重组噬菌体中，经过2轮筛选最终获得阳性克隆，挑选了3个分别命名为IL8-1，IL8-2，IL8-...

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丹参COR413基因克隆及表达分析 (2010年) 从丹参EST数据库筛选出一条与冷调节基因（cold-regulatedgene，C0R）家族同源性较高的基因序列，并利用PCR方法得到该基因的DNA序列，命名为SmCOR413。该基因DNA序列长1708bp，包含4个外显子和3个内含子，编码171个...

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玉米AFB2基因转化番茄的功能研究 玉米AFB2基因转化番茄的功能研究，杨春文，唐宁，通过生物信息学分析从玉米基因组数据库中筛选出一条全长cDNA序列命名为ZmAFB2，GenBank登录号NM_001143136.1。通过设计特异引物克隆该基因�

评级：0 浏览量：152 收藏量：0 资源大小：1.09MB 上传时间：2020-02-02

功能基因组学的老式方法：小鼠的化学诱变 越来越多的完整基因组序列的可用性刺激了模式生物中的全基因组诱变方法。 在理想的模型系统中，可以从任何给定基因的一系列突变中进行选择，以研究其功能、调控以及与其他基因的相互作用； 苍蝇和蠕虫及其丰富的突变...

评级：0 浏览量：40 收藏量：0 资源大小：157KB 上传时间：2021-06-29

针叶树GID1同源基因分离鉴定与功能预测 (2015年) 基于该基因序列同源克隆了樟子松、白皮松、赤松GID1基因，通过BLAST获得了日本落叶松、火炬松、白云杉与挪威云杉的GID1-like基因；针对叶树GID1基因进行序列保守性、蛋白结构和组织表达活性分析。

评级：0 浏览量：65 收藏量：0 资源大小：707KB 上传时间：2021-05-09

ADH2基因敲除与GPD1基因沉默研究 ADH2基因敲除与GPD1基因沉默研究，陈多，薛婷，为了高效的抑制GPD1基因的转录，在其反义序列前后加上了PGK强启动子、CYC1终止子以及KanMX 筛选标记，通过重叠延伸PCR的方法构建敲除沉�

评级：0 浏览量：82 收藏量：0 资源大小：427KB 上传时间：2020-02-12

猪Jiv90基因打靶载体的构建与细胞转染试验 (2011年) 【方法】根据NCBI中公布的Jiv90基因序列,克隆得到Jiv90基因核心区两侧的基因序列,并以此为长短臂,构建了可定点敲除Jiv90基因的打靶载体。用该载体转染SUVEC,通过新霉素(G418)和丙氧鸟苷(GANC)的筛选得到稳定的细胞株...

评级：0 浏览量：95 收藏量：0 资源大小：1.77MB 上传时间：2021-06-16

海洋防污细菌的筛选与鉴定 (2010年) 分别测定了725-1及725-4菌株的16S rRNA基因序列，分析了相关细菌相应序列的同源性，构建了系统发育树，结果表明：725-1为芽孢杆菌Bacillus sp．，725-4为Aeromonas molluscorum。实验室内利用藤壶幼虫变态率抑制试验...

评级：0 浏览量：40 收藏量：0 资源大小：318KB 上传时间：2021-05-24

高产纤维素酶菌株的筛选及产酶条件研究 (2005年) 从霉变的玉米芯中筛选到一株高产纤维素酶的菌株，经18S rRNA基因序列分析和菌株形态特性分析，确定该菌株为灰绿曲霉(Aspergillusglaucus)。利用固体纤曲培养产生纤维素酶。研究了培养基起始pH值、培养温度、培养时间...

评级：0 浏览量：83 收藏量：0 资源大小：348KB 上传时间：2021-06-14

论文研究 - 多巴胺转运蛋白基因之间的关联 我们以前曾报道多巴胺转运蛋白1（DAT1）基因的3'-UTR VNTR（串联重复的三个主要非翻译区可变数目的串联重复序列）与ED与暴饮暴食行为（EDBEB）相关。 在这里，我们调查了DAT1基因编码区中的变体是否也与EDBEB相关。...

评级：0 浏览量：81 收藏量：0 资源大小：343KB 上传时间：2020-06-02

靶向肝癌细胞的嵌合AAV建库及筛选 (2012年) 采用Shuffling的方法,将AAV1-9 Cap基因序列进行改组,筛选出高效靶向肝癌细胞的嵌合AAV载体。以pAAV-MCS载体为骨架,构建出含AAV2 ITR和Rep2序列的pAdB载体,在此基础上,构建含有嵌合Cap 序列的pARC载体库,用于转染293...

评级：0 浏览量：113 收藏量：0 资源大小：1.63MB 上传时间：2021-05-30

cry Ia基因小麦高效表达载体的构建 (2002年) 利用在禾谷类作物中表达效率较高的启动子Ubi对含目的基因cry Ia的现有载体进行了改造，并引入了筛选标记基因bar，为提高目的基因的表达水平，还在目的基因5′端引入了Ω和Kozak序列，3′端引入了 poly(A)序列。...

评级：0 浏览量：46 收藏量：0 资源大小：244KB 上传时间：2021-05-13

家蚕中PGRMC2基因的表达、纯化及转录分析 家蚕中PGRMC2基因的表达、纯化及转录分析，张春丽，张耀洲，从本实验室构建的家蚕蛹cDNA 文库中，筛选到一编码家蚕中类孕酮膜受体元件2蛋白的基因序列，基因登陆号为lcl|32723。比对分析该序列编

评级：0 浏览量：70 收藏量：0 资源大小：932KB 上传时间：2020-01-04

谷氨酸棒杆菌argG基因缺失菌株的构建 (2013年) 采用crossover PCR方法扩增带有argG基因上下游同源序列的DNA片段，连接至载体pK18mobsacB，构建敲除载体pK18-△argG，转化至C． glutamicum ATCC 13032，利用卡那霉素抗性正筛选和果聚糖蔗糖sacB基因负筛选获得argG...

评级：0 浏览量：64 收藏量：0 资源大小：292KB 上传时间：2021-04-24