3D_QSAR

分子对接及3D_QSAR研究 本文主要探讨的是二芳基三嗪类化合物作为HIV-1逆转录酶抑制剂的分子对接及3D-QSAR研究。HIV-1逆转录酶是一种关键的病毒蛋白，负责将病毒RNA转化为DNA，进而整合到宿主细胞的基因组中，是抗艾滋病药物设计的重要靶点...

评级：0 浏览量：172 收藏量：0 资源大小：767KB 上传时间：2013-06-28

SYBYL-X 2.0软件基础应用以及3D-QSAR模型构建使用说明 SYBYL软件中默认路径设置、分子结构绘图、分子结构导出与保存、分子结构导入及显示、小分子表单的创建及更新、小分子表单的导出、小分子力场优化、分子叠合、比较分子场分析CoMFA和比较分子相似性分析CoMSIA构建、...

评级：0 浏览量：335 收藏量：2 资源大小：2.37MB 上传时间：2023-08-02

3D-QSAR Analysis of SecA Inhibitors SecA抑制剂的三维定量构效关系研究，李敏勇，朱孟远，SecA在细菌分泌的多肽、蛋白质、以及膜的转移中扮演着很关键的角色，因此成为一个新型抗菌药设计靶点。我们通过对SecA的抑制活性建�

评级：0 浏览量：113 收藏量：0 资源大小：842KB 上传时间：2020-01-05

组胺H4受体配体的3D-QSAR模型分析 (2010年) 本文对一系列组胺 H4受体配体进行了基于VolSurf参数的QSAR建模分析，得到了较好的结果(r2=0.86，q2=0.64)，训练集模型对预测集具有良好的预测能力．参数分析表明分子体积与其活性成反比．具有适当的亲水性和较大的...

评级：0 浏览量：103 收藏量：0 资源大小：382KB 上传时间：2021-05-25

3D-QSAR and docking studies of suberoylanilide hydroxamic like analogues inhibitors of Histone ... SAHA类组蛋白去乙酰化酶抑制剂的分子对接和3D-QSAR研究，薛白，吉民，组蛋白去乙酰化酶（HDAC）对癌细胞的抑制作用在近几年的癌症治疗临床试验中被一再验证。本文对一些SAHA类似物的三维定量构效关系（3

评级：0 浏览量：94 收藏量：0 资源大小：320KB 上传时间：2020-02-06

一系列非核苷HIV-1逆转录酶抑制剂的基于受体和配体的3D-QSAR研究 此外，获得了带有目标3D结构（RT的结合位点）的CoMFA和CoMSIA等高线图，以更好地理解RT蛋白与抑制剂之间的相互作用以及对HIV-1抑制活性的结构要求。 我们表明，要使2-氨基-6-芳基磺酰基苯甲腈抑制剂具有明显的抑制...

评级：0 浏览量：126 收藏量：0 资源大小：2.43MB 上传时间：2021-02-22

N-(3-苯丙基)哌嗪类σ1受体配体的3D-QSAR研究* (2008年) 采用比较分子力场(CoMFA)分析法和比较分子相似性指数(CoMSIA)分析法，对34个N-(3-苯丙基)哌嗪类σ1受体配体进行三维定量构效关系(3D-QSAR)研究，建立了具有较强预测能力的3D-QSAR模型．并利用Gaussian 03程序，采用...

评级：0 浏览量：37 收藏量：0 资源大小：355KB 上传时间：2021-05-10

促分裂原活化蛋白激酶激活的蛋白激酶-2全新抑制剂的3D—QSAR研究 (2009年) 通过自组织分子场(SoMFA)分析方法建立了MK-2抑制剂——β咔啉衍生物的三维定量构效关系(3D-QSAR)模型。SoMFA模型的相关系数r2＝0.731，交叉验证相关系数q2＝0.686，标准偏差s＝0.388，Fisher检验值F＝63.538。该模型...

评级：0 浏览量：76 收藏量：0 资源大小：281KB 上传时间：2021-04-24

地棘蛙素类似物的CoMFA和CoMSIA的3D-QSAR研究 (2004年) 采用比较分子力场(CoMFA)分析法和比较分子相似性指标场(CoMSIA)分析法,进行偏最小二乘法(PIS)分析,建立了地棘蛙素类化合物的三维构效模型。通过验证,说明该系列化合物分子立体?⒕驳绯 ⑶饧

评级：0 浏览量：82 收藏量：0 资源大小：319KB 上传时间：2021-05-10

DATA类HIV-1 逆转录酶抑制剂的分子对接及3D-QSAR研究 DATA类HIV-1 逆转录酶抑制剂的分子对接及3D-QSAR研究，王琴，梅虎，对40个二芳基三嗪类HIV-1逆转录酶抑制剂进行了分子对接研究。结果表明2个疏水性芳香取代基团与结合口底部的疏水及范德华相互作用，�

评级：0 浏览量：119 收藏量：0 资源大小：818KB 上传时间：2020-03-02

细胞周期蛋白依赖性激酶CDK4抑制剂的3D-QSAR研究 (2008年) 采用比较分子场分析法(comparative molecular field analysis，CoMFA)和比较分子相似性指数分析法(comparative similarity indices analysis，CoMSIA)，系统研究了57个CDK4酶抑制剂的三维定量结构-活性关系．...

评级：0 浏览量：71 收藏量：0 资源大小：386KB 上传时间：2021-04-24

Design, synthesis and 3D-QSAR evaluation of pyrrolidine derivatives as MMP-2,9 Inhibitors 吡咯烷类基质金属蛋白酶抑制剂的设计合成及3D-QSAR分析，徐文方，尹文刚，基质金属蛋白酶是一族与肿瘤的发生、发展和转移密切相关的胶原蛋白酶，在确定胶原蛋白是MMP-2的天然底物，并且胶原蛋白中含有大量�

评级：0 浏览量：58 收藏量：0 资源大小：341KB 上传时间：2020-01-06

2(1H)-喹啉-2, 4-二酮类化合物抗小麦锈病的3D-QSAR研究 (2003年) 用比较分子力场分析（CoMFA）方法和比较分子相似性指数分析（CoMSIA）方法研究了21个2（1H）-喹啉-2，4-二酮类化合物抗小麦锈病的三维定量构效关系（3D-QSAR），发现用CoMFA方法可以找到最佳的3D-QSAR模型，并通过...

评级：0 浏览量：52 收藏量：0 资源大小：101KB 上传时间：2021-05-09

4-(1-哌嗪)类香豆素化合物体外抗血小板凝结活性的QSAR模型研究 (2013年) 采用Chem3D软件自带的分子力学MM2模块对17种4-（1-哌嗪）类香豆素化合物进行几何结构预优化。通过DFT中B3 LYP方法在6-31G（d，p）基组水平上对其进行几何构型的全优化。提取Gaussian以及HyperChem软件中相关的量子...

评级：0 浏览量：64 收藏量：0 资源大小：589KB 上传时间：2021-06-14

人工智能-机器学习-计算机辅助HIV1与戈谢病抑制剂分子设计研究.pdf 对于戈谢病抑制剂的研究，第四章综合运用了2D-QSAR、3D-QSAR和分子对接。2D-QSAR主要关注分子的拓扑和电荷性质，3D-QSAR则更注重空间排列。分子对接帮助确定了所有化合物的生物活性构象，并通过分析对接过程中产生的...

评级：0 浏览量：23 收藏量：0 资源大小：3.94MB 上传时间：2022-05-07

应用CoMFA及CoMSIA方法研究氮杂环类CCR5拮抗剂的三维定量构效关系 (2013年) 采用比较分子场分析(CoMFA)和比较分子相似性指数分析(CoMSIA)的方法研究氮杂环类CC趋化因子受体5(CCR5)拮抗剂的三维定量构效关系(3D-QSAR),并建立了相应的3D-QSAR模型。结果表明:采用这2种方法建立的3D-QSAR模型对该...

评级：0 浏览量：97 收藏量：0 资源大小：1.05MB 上传时间：2021-05-17

喹唑啉衍生物抗癌活性的比较分子力场研究 (2008年) 运用比较分子力场分析（CoMFA）方法，建立了16种标题化合物对鼠白血病抗癌活性的三维构效模型（3D-QSAR）。在CoMFA研究中，考察了网格结构、步长及探针原子等因素对统计结果的影响。该模型显示立体场、静电场对生物...

评级：0 浏览量：47 收藏量：0 资源大小：1017KB 上传时间：2021-05-09

大数据-算法-有毒有机污染物正辛醇空气分配系数KOA的定量预测方法.pdf 研究中建立了两种预测模型：碎片常数模型和基于Dragon描述符的3D-QSAR模型。 首先，针对卤代芳烃化合物，建立了预测不同温度下KOA的碎片常数模型。该模型通过5个碎片常数和1个结构修正因子，能预测氯代和溴代芳烃...

评级：0 浏览量：51 收藏量：0 资源大小：6.8MB 上传时间：2022-04-20

大数据-算法-苯并咪唑类缓蚀剂的定量构效关系研究及分子设计.pdf 在本研究中，15种苯并咪唑类化合物的3D-QSAR模型显示了良好的统计稳定性和预测能力，其中CoMFA和CoMSIA模型的交叉验证系数分别为0.541和0.581，非交叉验证系数分别为0.996和0.987。这些模型揭示了立体场、静电场和氢...

评级：0 浏览量：27 收藏量：0 资源大小：2.37MB 上传时间：2022-04-17

计算机辅助药物设计的方法学.ppt - 基于药效基团模型的三维结构搜寻：利用距离几何法（DG）、3D-QSAR（三维定量构效关系）、假想受点点阵（HASL）、分子形状分析（MSA）和比较分子场分析法（CoMFA）等方法，推断受体的空间结构并进行药物设计。...

评级：0 浏览量：21 收藏量：0 资源大小：2.09MB 上传时间：2023-05-28

比较分子相似性指数分析（COMSIA）用于皮质类固醇化合物的研究① (2007年) 比较分子相似性指数分析（CoMSIA）方法用于皮质类固醇类化合物的3D-QSAR研究，较系统地分析了立体场、静电场、疏水场、氢键受体场与氢键配体场及其协同作用对皮质类固醇化合物与人体CBG亲合力的贡献，并建立相应的3D...

评级：0 浏览量：106 收藏量：0 资源大小：5.26MB 上传时间：2021-05-12

网络技术-网络基础-氧代膦酸酯类化合物的CoMFA研究.pdf 本文特别关注3D-QSAR的子领域——比较分子场分析（Comparative Molecular Field Analysis, CoMFA），这是一种处理三维化学空间数据的模型构建技术。 Advanced CoMFA是一个强大的CoMFA扩展工具包，它包含了多个模块...

评级：0 浏览量：41 收藏量：0 资源大小：1.37MB 上传时间：2022-04-19

论文研究 - 查耳酮衍生物的结构活性计算和设计 基于查尔酮衍生物的抗肿瘤活性及其结构，通过CoMFA（比较分子场分析）方法分析了查尔酮衍生物的构效关系，然后建立了3D-QSAR（三维定量结构活性关系）模型。 分析结果表明，该模型具有良好的稳定性和预测能力，交叉...

评级：0 浏览量：84 收藏量：0 资源大小：471KB 上传时间：2020-05-21

(完整版)计算机辅助药物设计成功案例及行业发展方向.docx CADD的核心技术包括但不限于分子对接（Molecular Docking）、三维定量构效关系（3D-QSAR）分析、数据库搜寻和基于结构的药物设计。分子对接是一种预测小分子如何与靶标蛋白相互作用的技术，帮助设计能有效结合的药物...

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(完整版)计算机辅助药物设计成功案例及行业发展方向.pdf 此外，三维定量构效关系（3D-QSAR）分析通过对小分子的结构和活性数据进行统计建模，帮助优化药物分子的构效关系。数据库搜寻方法则允许研究人员在庞大的化学数据库中寻找潜在的药物候选物。 CADD的应用已经深入到...

评级：0 浏览量：33 收藏量：0 资源大小：173KB 上传时间：2022-11-05

药物设计学复习资料 (2).docx 它涵盖了多种策略和方法，如合理药物设计、高通量筛选、药物的体内过程（ADME/T）、基于靶点的药物设计、基于性质的药物设计、基于结构的药物设计、定量构效关系（QSAR）和三维定量构效关系（3D-QSAR）等。...

评级：0 浏览量：37 收藏量：0 资源大小：201KB 上传时间：2022-06-24

环己烯类神经氨酸酶抑制剂的三维定量构效关系研究 (2011年) 选取26个典型的环己烯类神经氨酸酶抑制剂,应用比较分子力场分析(CoMFA)方法,研究它们与神经氨酸酶(NA)的相互作用,建立了环己烯类NA抑制剂与NA的三维定量构效关系(3D-QSAR)模型.该模型的最佳非交叉验证系数R2为0.991,...

评级：0 浏览量：54 收藏量：0 资源大小：1.79MB 上传时间：2021-05-06

一类新型罗非昔布开环衍生物抗炎构效关系 (2004年) 用PM3半经验量化方法...并用SOM- FA2软件分析了全部化合物的3D-QSAR关系。结构优化表明活性RC开环衍生物具有类似RC的立体结构，构效关系研究也表明该类新型RC开环衍生物具有其它环氧合酶选择性抑制剂相似的构效关系。

评级：0 浏览量：37 收藏量：0 资源大小：291KB 上传时间：2021-05-21

水杨酸类酪氨酸蛋白磷酸酯酶1B抑制剂的分子对接和三维定量构效关系研究 (2014年) 据此,利用Topomer CoMFA建模时将头尾结构切开分析,从21个化合物中随机选取17个化合物作为训练集,建立3D- QSAR模型,并用包括4个化合物的测试集验证模型的外部预测能力,结果显示模型具有良好的预测能力,预测活性与实测...

评级：0 浏览量：49 收藏量：0 资源大小：369KB 上传时间：2021-05-07

β微管蛋白中紫杉醇(Taxol)结合腔的性质分析 (2006年) 采用多拷贝同时搜寻法（MCSS），并结合现有微管抑制剂的SAR及3D-QSAR对β微管蛋白中Taxol（紫杉醇）结合腔的性质进行了分析。结构研究结果表明，Taxol结合腔以疏水性质为主，并指出官能团分布的具体位置：在Phe270...

评级：0 浏览量：39 收藏量：0 资源大小：2.85MB 上传时间：2021-05-10

02章新药研究与开发概论.pptx 构效关系研究是实验数据的总结，可以通过二维或三维定量构效关系（2D-QSAR或3D-QSAR）进行深入探究，为分子设计提供指导。 在药物分子设计的策略基础上，多样性和互补性是关键。天然产物因其生物多样性的特性，成为...

评级：0 浏览量：25 收藏量：0 资源大小：267KB 上传时间：2021-09-26

PaDEL-descriptor-ws:PaDEL ws描述符引擎 该软件当前可计算1875个描述符（1444个1D，2D描述符和431个3D描述符）和12种指纹（共16092位）。 eTOXlab是用于在生产环境中开发和部署QSAR模型的建模框架。 eTOXlab的主要目标之一是平台的鲁棒性。 为了实现这一...

评级：0 浏览量：1214 收藏量：1 资源大小：65.02MB 上传时间：2021-05-09

Comparative Molecular Field Analysis (CoMFA) ofCurcumin-related Compounds for Anticancer Activity ... Three-dimensional (3D) quantitative structure-activity relationship (QSAR) studies of 44 curcumin-related compounds have been carried out based on our previously reported result for their anticancer ...

评级：0 浏览量：47 收藏量：0 资源大小：506KB 上传时间：2021-05-18

MopacPro 量子化学 计算软件 It is also used as the basis of quantitative structure-property (or activity) relationships (QSAR), to predict a wide variety of biological and other properties such as carcinogenicity, vapor ...

评级：4 浏览量：753 收藏量：3 资源大小：3MB 上传时间：2011-05-11