遗传距离

mega5进化树绘制遗传距离分析 强大的分子生物学软件 简单易上手 好用 该版本实用

评级：0 浏览量：3484 收藏量：0 资源大小：55.07MB 上传时间：2019-04-15

利用全基因组SNP芯片分析油菜遗传距离与杂种优势的关系.pdf 在探讨油菜遗传距离与杂种优势的关系时，研究者们利用了全基因组单核苷酸多态性（SNP）芯片技术。首先需要明确SNP是指在基因组水平上单个核苷酸发生变异的位点，它是基因组研究中的一个重要遗传标记，用于分析个体间...

评级：0 浏览量：126 收藏量：0 资源大小：610KB 上传时间：2021-07-26

3个STR位点在中国7个民族遗传距离中的研究 (2004年) 研究了D16S539，D7S820和 D13S713 3个STR位点在新疆锡伯族和哈萨克族中的遗传结构，结合汉族、黎族、朝鲜族、藏族和维吾尔族相同位点的相关遗传资料，应用亲缘系数和遗传距离研究了7个民族间的遗传关系，并根据遗传...

评级：0 浏览量：97 收藏量：0 资源大小：267KB 上传时间：2021-05-13

基于RSAP和SSR的辣椒优良自交系间遗传距离的估计与比较 (2007年) 作物F1代的杂种优势表现与亲本间的遗传距离直接相关，对自交系间遗传距离的估计可被用来预测杂种优势。针对我国鲜食尖椒的育种目标，利用RSAP和SSR标记系统，对来自国内外的10份尖椒优良自交系间的遗传距离进行估计...

评级：0 浏览量：77 收藏量：0 资源大小：457KB 上传时间：2021-06-16

基于遗传距离的粘孢子虫分类研究 (2014年) 以18S rDNA作为分子标记研究了以粘孢子虫(Myxosporidia)常见属为代表的不同分类水平下的遗传距离分布规律。结果表明,粘孢子虫亲缘关系的远近与遗传距离具有明显的相关性,即粘孢子虫亲缘关系越远遗传距离越大,反之...

评级：0 浏览量：47 收藏量：0 资源大小：599KB 上传时间：2021-05-26

水稻功能基因SSR标记遗传距离与杂种优势的相关性 水稻功能基因SSR标记遗传距离与杂种优势的相关性，郑家奎，倪先林，利用41对功能基因SSR引物分析了29个水稻品种间（18个不育系和11个恢复系）的遗传差异，结合29个亲本所配组合（47个）的F1表现，研究了S

评级：0 浏览量：127 收藏量：0 资源大小：258KB 上传时间：2020-02-25

杂交稻特殊配合力与杂种优势、亲本间遗传距离的相关性 杂交稻特殊配合力与杂种优势、亲本间遗传距离的相关性，倪先林，张涛，杂交水稻育种的实质是配合力育种，筛选高特殊配合力的杂交水稻才能选育出强优势组合。本研究利用SSR标记检测了9个三系杂交稻亲本�

评级：0 浏览量：182 收藏量：0 资源大小：264KB 上传时间：2020-03-03

NTSYS遗传相似性系数计算及聚类分析方法说明书 NTSYS遗传相似性系数计算及聚类分析方法说明书 本文档旨在详细说明NTSYS软件中遗传相似性系数计算及聚类分析的步骤。通过本文档，读者可以轻松地了解和掌握遗传相似性系数计算及聚类分析的方法。 数据输入和格式...

评级：0 浏览量：2970 收藏量：5 资源大小：265KB 上传时间：2018-11-15

低酚棉与有酚棉的遗传距离和F1、F2杂种优势的相关分析 低酚棉与有酚棉的遗传距离和F1、F2杂种优势的相关分析，张勇，张桂寅，本研究以10个低酚棉和2个有酚棉及其组配的F1、F2为材料，利用SSR分子标记和田间表型数据，估算了供试材料的分子标记遗传距离和表型�

评级：0 浏览量：125 收藏量：0 资源大小：259KB 上传时间：2020-01-03

poppr:package R包，用于对混合（克隆性）生殖种群进行遗传分析 引导距离支持遗传距离的树状图的绘制 遗传距离的最小跨度网络图 关联指数的计算（ ） 或者 （ ） 已安装R（≥2.15.1）的任何服务器上的批处理 微卫星（SSR）标记的Bruvo距离的计算（以C表示为速度） 从导入数据并...

评级：0 浏览量：391 收藏量：0 资源大小：2.5MB 上传时间：2021-05-04

遗传算法_遗传算法_遗传_ 在TSP中，这通常是路径的总距离，越短的路径适应度越高。 3. 选择操作：根据适应度值，选择一部分个体作为父代进行繁殖。常见的选择策略有轮盘赌选择、锦标赛选择等。 4. 交叉操作：模拟生物的基因重组，将两个父...

评级：0 浏览量：127 收藏量：0 资源大小：102KB 上传时间：2021-10-01

TSP遗传算法 TSP问题可以表述为：给定一组城市之间的距离，寻找访问所有这些城市恰好一次并回到起点的最短路径。该问题在组合优化领域具有重要的理论意义和应用价值，比如物流配送、电路板布线等。 #### 1.2 遗传算法简介 遗传...

评级：0 浏览量：150 收藏量：0 资源大小：27KB 上传时间：2018-12-02

vcfpop：基于NGS数据对单倍体，二倍体，多倍体和非整倍体进行群体遗传学分析 2. **群体结构分析**：通过计算个体间的遗传距离和遗传相似性，识别群体内的结构，帮助研究人员理解种群的分化和历史。 3. **遗传多样性的量化**：计算如遗传多样性指数（如π和θ）、 Tajima's D、Fst等统计量，...

评级：0 浏览量：316 收藏量：1 资源大小：12.62MB 上传时间：2021-02-18

遗传算法、遗传算法、遗传算法、遗传算法 对于给定的100个目标点和一个基地，通过构建距离矩阵，遗传算法可以生成一系列可能的路径，通过交叉和变异操作不断改进，最终找到最短的飞行路径。 在实际应用遗传算法时，需要调整的参数包括种群大小、最大迭代...

评级：0 浏览量：102 收藏量：0 资源大小：117KB 上传时间：2023-07-25

有关遗传算法相关原理讲解 - **实例**：在旅行商问题(TSP)中，适应度函数通常设定为路径总距离的倒数，因为目标是最小化总路径长度。 #### 总结 遗传算法作为一种启发式搜索算法，其核心在于模拟自然界中的遗传进化过程来解决问题。通过选择...

评级：0 浏览量：34 收藏量：0 资源大小：3.99MB 上传时间：2024-06-06

matlab遗传算法仓库拣货距离最短代码.rar 在本文中，我们将深入探讨如何使用MATLAB实现遗传算法来解决仓库拣货距离最短问题。遗传算法是一种基于自然选择和遗传原理的全局优化方法，它通过模拟生物进化过程中的基因重组、突变和选择机制来寻找问题的最优解。...

评级：0 浏览量：1001 收藏量：17 资源大小：55KB 上传时间：2021-05-15

TSP.rar_遗传 2. 评价适应度：根据每个个体（路径）的总距离（旅行成本）计算其适应度。 3. 选择操作：根据适应度值选择一部分个体进行繁殖，这在GA2中进行了优化。 4. 遗传操作：通过交叉（Crossover）和变异（Mutation）操作...

评级：0 浏览量：21 收藏量：0 资源大小：633KB 上传时间：2022-09-24

OTU遗传发育信号检验 )，即在较小的遗传距离下，遗传发育距离越大，其生态位距离越大(Q2:为什么是较小的遗传距离下有遗传距离发育信号即可，不需要整个的遗传距离呢？)。本文将介绍三种方法检测近距离下的遗传发育信号，并用R语言实现。

评级：0 浏览量：318 收藏量：0 资源大小：1.78MB 上传时间：2022-04-01

TSP_遗传算法TSP_ 在TSP中，适应度函数通常为路径的总距离，距离越短，适应度越高。然后，通过轮盘赌选择法，根据适应度值的比例确定下一代的个体。 交叉操作是遗传算法的关键，对于TSP问题，可以采用部分匹配交叉（PMX）、有序交叉...

评级：0 浏览量：319 收藏量：1 资源大小：1KB 上传时间：2021-10-02

遗传算法资料 遗传算法可以通过编码城市顺序为个体，适应度值为总距离来解决。 2. 背包问题：在容量限制下，选择物品以最大化总价值。个体可以表示为物品选择的状态，适应度值为总价值。 3. 函数优化：寻找使目标函数值最小的...

评级：0 浏览量：46 收藏量：0 资源大小：6.84MB 上传时间：2018-08-06

遗传算法最短路径MATLAB程序 对于最短路径问题，适应度函数通常是路径的总距离或成本的相反数，使得距离越短，适应度越高。 6. **终止条件**：算法会根据预设的迭代次数或满足特定的性能指标（如连续几代没有明显改进）来决定何时停止。 ...

评级：0 浏览量：3594 收藏量：16 资源大小：6KB 上传时间：2018-04-09

Niched_小生境遗传算法_ 通常使用距离或相似度指标，如欧氏距离或余弦相似度。 4. 选择操作：在每个小生境内，根据适应度值进行选择，保留优秀个体，淘汰较差个体。 5. 交叉和变异：在每个小生境内，选择一对或几对个体进行交叉操作，生成...

评级：5 浏览量：364 收藏量：1 资源大小：1.39MB 上传时间：2021-10-02

「群体遗传学实战」第二课的代码 每个点代表一个样本，点的位置反映了其在PCA空间中的位置，从而揭示了样本间的遗传距离和结构。 在提供的链接文章中，作者详细介绍了如何使用Python的生物信息学库，如`pandas`、`numpy`和`matplotlib`来实现这一...

评级：0 浏览量：616 收藏量：0 资源大小：202KB 上传时间：2021-08-18

shortlujing_遗传算法_ 《遗传算法在旅行商问题中的应用详解》 遗传算法（Genetic Algorithm，简称GA）是一种模拟生物进化过程的全局优化算法，由美国科学家John Holland在20世纪60年代提出。这种算法通过模拟自然选择、遗传和突变等生物...

评级：0 浏览量：18 收藏量：0 资源大小：3KB 上传时间：2021-10-03

yichuansuanfaTSP_遗传算法_ 《遗传算法在解决旅行商问题（TSP）中的应用》 旅行商问题（Traveling Salesman Problem，简称TSP）是图论中的一个经典问题，它描述了一个旅行商需要访问多个城市，每个城市只访问一次，并且最后返回出发城市，求出...

评级：0 浏览量：21 收藏量：0 资源大小：4KB 上传时间：2021-10-01

遗传算法.docx 《遗传算法解决旅行商问题》 旅行商问题（TSP，Traveling Salesman Problem）是一个经典的组合优化问题，其核心是寻找一条经过所有城市恰好一次并返回起点的最短路径。遗传算法是一种模拟生物进化过程的优化算法，...

评级：0 浏览量：31 收藏量：0 资源大小：61KB 上传时间：2023-07-06

系统发育分析中DNA序列距离计算的新方法 本文所介绍的新方法，不仅提供了一种绕过多重序列比对复杂性的新途径，而且提供了一种更为直接和高效的计算物种间遗传距离的方法。其核心在于将序列信息转化为数值化的特征向量，并通过数学上的距离计算方法来量化...

评级：0 浏览量：121 收藏量：0 资源大小：261KB 上传时间：2021-03-10

GATSP_遗传算法_ 《MATLAB实现遗传算法解决31城市旅行商问题详解》 遗传算法（Genetic Algorithm，简称GA）是一种基于生物进化理论的全局优化方法，由John Holland在20世纪60年代提出。它模拟了生物进化过程中的自然选择、基因重组...

评级：0 浏览量：95 收藏量：0 资源大小：2KB 上传时间：2021-09-30

遗传算法解决N个城市之间旅行问题 问题描述：旅行商去N个城市旅行，这N个城市中，任意两个城市之间都有一条路径，路径的长度按照两个城市之间的直线距离计算。找出一条路径，使得旅行商从A城市出发经过所有的城市再回到A城市，所经过的路径最短，每个...

评级：0 浏览量：298 收藏量：1 资源大小：296KB 上传时间：2022-02-15

geneticalgorithms_遗传算法_ 在本例中，适应度函数可能是基于经纬度数据计算出的某个成本或者距离函数。 遗传算法的主要步骤如下： 1. 初始化种群：随机生成一定数量的初始个体，每个个体代表一组经纬度坐标，这些坐标构成了问题的潜在解。 2...

评级：0 浏览量：52 收藏量：0 资源大小：1KB 上传时间：2021-10-03

遗传算法优化最佳路径 2. **适应度函数**：根据特定的路径评价标准（如距离最短、时间最短等）计算每个个体的适应度值。 3. **选择操作**：按照适应度比例选择个体，进行下一轮迭代。 4. **交叉操作**：选取两个个体，按照一定的规则...

评级：0 浏览量：30 收藏量：0 资源大小：3KB 上传时间：2021-09-30

AdaW_遗传算法_ 通常采用非支配排序和拥挤距离等策略来计算个体的适应度。 **三、算法流程** 1. **初始化**：创建初始种群，每个个体代表一组权重向量。 2. **计算适应度**：根据多目标优化问题的Pareto最优性质，计算每个个体的...

评级：5 浏览量：83 收藏量：0 资源大小：174KB 上传时间：2021-09-30

遗传算法的matlab程序 遗传算法是一种基于生物进化原理的优化方法，由John Holland在20世纪60年代提出，主要应用于解决复杂问题的全局优化。它模拟了自然选择、遗传、变异等生物学过程，通过迭代的方式寻找问题的最优解。在MATLAB环境中，...

评级：0 浏览量：179 收藏量：0 资源大小：27KB 上传时间：2018-05-02

遗传算法_DEMO_遗传算法_ 在旅行商问题中，遗传算法的适应度函数通常是旅行路径的总距离，路径短的个体适应度更高。交叉操作可能会交换两个个体的城市顺序，而变异操作可能随机改变个别城市的位置。经过多代迭代，种群中的最优个体（即适应度...

评级：0 浏览量：84 收藏量：0 资源大小：2KB 上传时间：2021-09-30

MATLAB多目标遗传算法 3. 选择操作：使用拥挤距离或其他策略选择优秀的个体进入下一代。 4. 交叉操作：选取两个父代个体进行基因交换，生成新的子代个体。 5. 突变操作：对子代个体进行随机改变，保持种群的多样性。 6. 迭代：重复上述...

评级：1 浏览量：2878 收藏量：6 资源大小：3KB 上传时间：2018-03-28

基于遗传算法的路径规划matlab代码 遗传算法是一种模拟自然选择和遗传学机制的优化技术，它在解决复杂问题，如路径规划，上具有广泛应用。本文将详细解析如何利用MATLAB实现基于遗传算法的路径规划。 首先，我们要理解路径规划的基本概念。在机器人学...

评级：0 浏览量：0 收藏量：4 资源大小：148KB 上传时间：2020-02-27

VRP遗传算法的Matlab代码 在VRP中，这可能是总距离、总成本或服务时间等。常用的策略有轮盘赌选择、锦标赛选择等。在Matlab中，可以使用`randi`函数或者自定义函数来实现。 3. **交叉（Crossover）**：交叉操作是模拟生物遗传的过程，将两个...

评级：4 浏览量：3082 收藏量：23 资源大小：6KB 上传时间：2018-06-12

遗传算法入门到掌握_遗传算法 例如，对于旅行商问题，可以将城市视为基因，行程路径作为解，总距离作为适应度。 本教程提供的“遗传算法入门到掌握.pdf”文件将详细介绍遗传算法的基本原理、操作步骤，并可能包含具体编程实现的示例，通过阅读和...

评级：0 浏览量：83 收藏量：0 资源大小：1.18MB 上传时间：2021-09-10

遗传算法解决TSP问题 旅行商问题是一个经典的组合优化问题，描述为：给定一个包含n个城市的图，每个城市之间有距离，旅行商需要找出访问每个城市一次并返回原点的最短路径。这是一个典型的NP完全问题，意味着没有已知的多项式时间算法...

评级：0 浏览量：899 收藏量：1 资源大小：3KB 上传时间：2019-05-05

TSP.zip_tsp遗传算法java_遗传算法 _遗传算法；城市距离优化 《遗传算法在旅行商问题中的应用——以Java实现为例》 旅行商问题（Traveling Salesman Problem，简称TSP）是运筹学中一个经典的组合优化问题，它旨在寻找最短的可能路线，使得旅行商可以访问每个城市一次并返回...

评级：0 浏览量：72 收藏量：0 资源大小：5KB 上传时间：2022-09-15

main_遗传算法_源码 《遗传算法在车辆调度问题中的应用》 遗传算法（Genetic Algorithm, GA）是一种借鉴生物进化理论，模拟自然选择和遗传机制的优化方法。在计算机科学领域，特别是运筹学和人工智能中，遗传算法被广泛应用于解决复杂...

评级：0 浏览量：31 收藏量：0 资源大小：4KB 上传时间：2021-10-02

遗传算法求解vrp问题 【遗传算法求解VRP问题】是利用生物进化过程中自然选择和遗传机制的模拟来解决复杂优化问题的一种方法。在MATLAB环境中应用遗传算法，可以有效地寻找车辆路径问题（Vehicle Routing Problem, VRP）的最优解决方案。 ...

评级：5 浏览量：2117 收藏量：17 资源大小：21KB 上传时间：2019-01-19

基于matlab遗传算法及其应用实例 通过将网络划分为若干个簇，每个簇有一个簇头节点负责收集和转发簇内其他节点的数据，可以减少通信距离，降低能耗。 在描述的应用实例中，遗传算法可能用于优化分簇过程，例如确定最佳的簇头节点分配、簇的数量、...

评级：0 浏览量：104 收藏量：2 资源大小：756KB 上传时间：2022-11-05

TSP.rar_TSP遗传算法 《旅行商问题与遗传算法的C语言实现》 在计算机科学中，旅行商问题（Traveling Salesman Problem，简称TSP）是一个经典的组合优化问题，它源于实际生活中的配送路线规划。该问题的基本设定是：一个销售员需要访问n...

评级：0 浏览量：45 收藏量：0 资源大小：4KB 上传时间：2022-09-22

GA遗传算法matlab程序 可能考虑的因素有安全距离、时间效率、舒适度指标等。 4. 实体表示：如何将列车速度曲线问题转化为遗传算法可操作的形式，例如用一串数字序列表示不同的速度曲线。 5. ATO系统模型：理解ATO系统的基本原理，包括...

评级：0 浏览量：3724 收藏量：14 资源大小：8KB 上传时间：2018-12-11

遗传算法解决TSP问题MATLAB实现 给定一组n个城市和俩俩之间的直达距离，寻找一条闭合的旅程，使得每个城市刚好经过一次且总的旅行距离最短。 TSP问题也称为货郎担问题，是一个古老的问题。最早可以追溯到1759年Euler提出的骑士旅行的问题。1948年...

评级：0 浏览量：233 收藏量：0 资源大小：4KB 上传时间：2022-11-20

matlab遗传算法路径规划 适应度函数衡量一个路径的好坏，通常以路径长度或与障碍物的距离作为评估标准。然后，创建初始种群，这是一组随机生成的路径。接着，通过以下步骤迭代优化： 1. **选择**：根据适应度函数的值，选择一部分优秀的...

评级：5 浏览量：127 收藏量：0 资源大小：4KB 上传时间：2024-04-13

GA.zip_传统遗传算法 这些辅助函数分别处理数据转换、路径绘制、序列反转、选择策略、路径长度计算、重插入操作和距离计算等任务，它们为遗传算法的运行提供了必要的支持。 6. **dsxy2figxy.m**：可能将二维坐标数据转换为适合MATLAB...

评级：0 浏览量：34 收藏量：0 资源大小：31KB 上传时间：2022-09-23

遗传算法实现CVRP【matlab】 遗传算法是一种模拟自然界生物进化过程的优化方法，它在解决复杂优化问题时具有广泛的应用，如车辆路径问题（Vehicle Routing Problem, VRP）。CVRP（ Capacitated Vehicle Routing Problem）是VRP的一种变体，主要...

评级：0 浏览量：578 收藏量：2 资源大小：5KB 上传时间：2020-04-26

tsp_遗传算法TSP_ 标题中的“tsp_遗传算法TSP_”指的是使用遗传算法来解决旅行商问题（Traveling Salesman Problem，简称TSP）。旅行商问题是一个经典的组合优化问题，它询问的是：给定一组城市和每对城市之间的距离，找到访问每个...

评级：0 浏览量：68 收藏量：0 资源大小：2KB 上传时间：2021-09-28