NCBI数据库的使用与功能介绍.ppt

NCBI 数据库的使用与功能介绍 NCBI（National Center of Biotechnology Information）是美国国立医学图书馆（NLM）于 1988 年 11 月 4 日建立的国家生物技术信息中心。NCBI 的主要任务是建立关于分子生物学、生物化学和遗传学知识的存储和分析的自动系统，并实行基于计算机的信息处理的先进方法，以研究生物学重要分子和复合物的结构和功能。 NCBI 首先创建了 GenBank 数据库，并于 1991 年开发了 Entrez 数据库检索系统。Entrez 系统整合了 GenBank、EMBL、PIR 和 SWISS-PROT 等数据库的序列信息，以及 MEDLINE 有关序列的文献信息，并通过相关链接，将他们有机地结合在一起。 Map Viewer 是 NCBI 网站上提供的一个非常有用的寻找基因的工具。通过 Map Viewer，可以了解您感兴趣的基因在基因组中的位置、基因序列、内含子及外显子的排列、基因的细胞遗传学图、EST、SNP 等许多有用的信息。使用 Map Viewer，还可以查找基因序列、mRNA 序列、启动子 Promoter。 在使用 NCBI 数据库时，可以使用 BLAST 工具来进行序列比对。BLAST 可以对核酸和蛋白的多种数据库操作，有几种比较方法可选择： * Blastp：一个氨基酸序列与一个蛋白数据库比较 * Blastn：一个核酸序列与一个核酸数据库比较 * Blastx：一个核酸的所有读框与一个蛋白数据库比较，可以用来发现未知核酸可能的蛋白产物 * Tblastn：一个蛋白序列与翻译成所有读框的核酸数据库比较 * Tblastx：一个核酸的六种读框与一个核酸据库的六种读框比较 使用 NCBI 数据库和 BLAST 工具，可以对基因序列、mRNA 序列、蛋白序列进行查找和分析，还可以发现新的基因、蛋白和功能结构域。 在实际应用中，NCBI 数据库和 BLAST 工具可以用于基因组学、蛋白组学、基因表达分析、蛋白结构预测等领域，并且可以与其他生物信息学工具和数据库集成，以进行更深入的生物信息学研究和分析。 NCBI 数据库和 BLAST 工具是生物信息学研究和分析的重要资源，为研究人员提供了强大的工具和平台，以便更好地理解生命科学和生物技术。