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分割fasta文件的python脚本
分割fasta文件的python脚本
分割序列
python脚本
分割基因
均分序列
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2018-08-21
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文件脚本可将大的fasta文件中的序列,按照个数均分,分割成多个fasta文件,便于对各个小文件中的序列进行后续操作
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Remove-duplicate-fasta:Python脚本删除重复的Fasta序列
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删除重复的Fasta -Python script to remove whole duplicate fasta sequences i.e identical sequence and header -input file must be in fasta format usage: python remove_duplicate_fasta.py inputfile outputfi
python文件按行分割脚本
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由于notepad++打不开大于500MB的文本文件,所以写了这段脚本,可以按随意的行数分割大文件,使用很方便。
使用python进行拆分大文件的方法
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今天小编就为大家分享一篇使用python进行拆分大文件的方法,具有很好的参考价值,希望对大家有所帮助。一起跟随小编过来看看吧
python大文本文件拆分
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输入文件路径,包括文件名。例如:'''D://test.txt''' 按行拆分,输入每个文件最大行数,拆分后的文件在相同路径下。
Python导入fasta格式的数据,并把多行碱基变为一行
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以前导入数据时都是一行行的导入,有时需要根据数据指定特定的分隔符,比如以>开头的fasta数据,在处理过程中顺便把多行的碱基序列变成了一行,自己摸索的写出来的
fasta文件的切分算法——java实现
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用于切分fasta文件,因为是按行读取,可以做到切分后每个子文件大小基本一致,并不会改变fasta文件的格式 也可以用于切分普通文件,主要注释掉判断 包不包含>那个if就可以了 如要切分fastq文件,可以先将fastq文件转化为fasta文件
用Python实现大文本文件切割的方法
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python 实现将txt文件多行合并为一行并将中间的空格去掉方法
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Python-从Python高效处理FASTQ文件
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fasta基因文件统计脚本
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计算N50的python脚本
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文件用于计算fasta文件中基因序列的N50、基因条数、最短最长的序列...将脚本文件拷贝至fasta文件目录下,使用方法:python cal_N50.py 跳出“Enter your fasta/fa name: ”后,输入你当前目录下的fasta文件名后回车即可
扩增子分析中需要使用到的python脚本
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扩增子分析中需要使用到的python脚本,注意脚本是python2的脚本,注意环境最好是配置python2.7,主要脚本内容:die.py,fasta_number.py,fastq.pyc,primer.pyc,revcomp_lib.py,die.pyc,fasta.py,fastq_strip_...
计算N50的python脚本.zip
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文件用于计算fasta文件中基因序列的N50、基因条数、最短最长的序列...将脚本文件拷贝至fasta文件目录下,使用方法:python cal_N50.py 跳出“Enter your fasta/fa name: ”后,输入你当前目录下的fasta文件名后回车即可
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