医学配准软件和库的安装介绍.pdf
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2019-10-17
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医学配准软件和相关python库的介绍和安装
1. ants源码安装和使用介绍
1.1 ants介绍
ANTs(Advanced Normalization Tools)是目前配准质量最好的软件 ，是基于c语言写的，运行速度很快
1.2 ants安装
官网上有安装方法介绍：ANTs源码安装；此安装方法适用于 linux和Mac；具体过程如下：
（1）安装git , cmak 和 c++编译器；
（2）在命令行中分别执行以下命令（假设当前目录在主目录下）：
（3）设置环境变量，并添加到 .bashrc 或者.profile文件中，即：
（4）激活
source ~/.profile #激活环境变量设置；后面就可以使用了
注意：这个安装过程，充满了玄之又玄的味道；经常会报错，记得按照这个流程多重复几次，或许就可
以安装成功；
1.3 ants使用
（1）使用 antsRegistrationSyN.sh 配准
这个.sh文件在 /home/username/ANTs/Scripts 路径下： 进入这个路径，就可以看到各种各样的.sh文
件，但是较为常用的，就是 antsRegistrationSyN.sh；
git clone git://github.com/stnava/ANTs.git
mkdir antsbin
cd antsbin
ccmake ../ANTs
make -j 4
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cd #回到home目录，在该目录下会看到.profile和.bashrc文件
vim .profile #打开.profile文件，输入 i ,进行插入编辑；在文件最后加入如下两句：
export ANTSPATH=/home/username/antsbin/bin/
export PATH=“$ANTSPATH:$PATH”
#按Esc，shift+ : , w+q保存并退出；
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