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脊髓灰质炎
脊髓灰质炎
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脊髓灰质炎
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polio-master
EventDriven
validation_code
main.cpp
11KB
mass_action_SIR_use_for_IBMvsGill_valid.cpp
4KB
EventDriven_Sim_nonexp_recovery_waningfn_withEnv.hpp
24KB
EventDriven_Sim_exp_recovery_homogeneous_pop.hpp
13KB
EventDriven_Sim_with_age_with_env_1.hpp
31KB
EventDriven_Sim_no_age.hpp
18KB
EventDriven_Sim_exp_recovery.hpp
20KB
EventDriven_MassAction_Sim.h
24KB
mass_action_SIR_test.cpp
2KB
mass_action_SIR.cpp
1KB
EventDriven_Sim_nonexp_recovery_waningfn_ENV.hpp
36KB
EventDriven_Sim_with_age_1.hpp
26KB
IBM
main_EventDrivenIBM_abcsmc.cpp
2KB
EventDriven_Sim.hpp
35KB
main_EventDrivenIBM.cpp
4KB
avg_age_at_first_infect.json
827B
EventDriven_parameters.hpp
6KB
adjustable_boxcar_model.h
192B
Metapopulation_model
Model_output
Archive_0pcase.zip
167KB
Archive_I1_IR_burnin.zip
226KB
Archive_P_burnin.zip
319KB
Archive_time_bet_pcase_part3.zip
21.32MB
Archive_time_bet_pcase_part2.zip
33.21MB
Archive_R_burnin.zip
326KB
Archive_extinction_intervals.zip
911KB
Archive_time_bet_pcase_part4.zip
40.24MB
Archive_time_bet_pcase_part1.zip
26.09MB
Archive_S_burnin.zip
263KB
Archive_num_Ir_bet_case.zip
39.61MB
Archive_num_I1_bet_case.zip
32.63MB
SC_statistic_output
Archive_16x4000_mig_0point1.zip
4.71MB
Archive_0pcase.zip
639KB
Archive_2x32000.zip
25.04MB
Archive_32x2000_mig_0point1.zip
3.12MB
Archive_1x2000.zip
250KB
Archive_4x16000.zip
45.75MB
Archive_8x8000_mig_0.zip
861KB
Archive_mixed_pop.zip
28.23MB
Archive_8x8000_mig0point1.zip
7.51MB
Archive_16x4000_mig_0.zip
577KB
Archive_4x16000_mig_0point1.zip
12.69MB
Archive_single_pop.zip
5.82MB
Archive_1x64000.zip
21.86MB
Archive_32x2000_mig_0.zip
452KB
Archive_16x4000.zip
28.56MB
Archive_4x16000_mig_0.zip
1.91MB
Figures
SC_16x4000_mig_comp_v3.png
167KB
boxplot_starting_S_v1.png
167KB
interInt_dist_noMig_multipatch_paper_v1.png
136KB
boxplot_starting_R_v1.png
163KB
extInt_dist_singlePop_paper_v1.png
153KB
qqplot_64000_metapop_ir_pcase_paper_v2.png
213KB
qqplot_64000_metapop_ir_pcase_ext_paper_v2.png
206KB
boxplot_starting_IR_v1.png
232KB
boxplot_starting_P_v1.png
141KB
qqplot_64000_metapop_i1_pcase_paper_v2.png
207KB
psc_differential_metapop_paper_v1.png
173KB
boxplot_starting_I1_v1.png
258KB
qqplot_64000_metapop_i1_pcase_ext_paper_v2.png
211KB
SC_4x16000_mig_comp_v5.png
152KB
extInt_dist_noMig_multipatch_paper_v1.png
165KB
psc_differential_metapop_paper_mig01_v1.png
165KB
interInt_dist_singlePop_paper_v1.png
137KB
interInt_dist_migRate0point1_multipatch_paper_v1.png
120KB
extInt_dist_migRate0point1_multipatch_paper_v1.png
160KB
Plotting_Scripts
comp_inf_geo_dist.R
34KB
boxplot_starting_cond.R
13KB
plot_sc_stat_comp.R
20KB
interval_dist_curves.R
28KB
C++
silent_circulation_statistic_calculation.cpp
5KB
main_Gillespie_multivillage_TTE.cpp
36KB
LICENSE
34KB
Gillespie_Model
main_Gillespie.cpp
9KB
gillespie_test_plot.R
2KB
Makefile
2KB
PDE_Model
integration_test2.cpp
3KB
PDE_Simulator.cpp
11KB
integration.h
10KB
PDE_Simulator_abc.cpp
11KB
integration_test.cpp
12KB
abc_config_sql.json
857B
PDE_Simulator_corrected.cpp
11KB
Boxcar_Model
Polio_boxcar_parameters.h
4KB
adjustable_boxcar_model.h
5KB
Polio_boxcar_simulator.cpp
3KB
Polio_boxcar_model_extended_waning.h
3KB
DIFFEQ_SIM.h
3KB
Polio_boxcar_model.h
4KB
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