filter_probes:过滤 Illumina HT-12 v4 探针以确定 HapMap CEU SNP 的存在

目的 群体中常见的单核苷酸多态性 (SNP) 会影响基因表达微阵列的杂交动力学。 这对于调查个体之间基因表达差异的研究来说尤其麻烦。 用法 克隆存储库： git clone git@github.com:jdblischak/filter_probes.git cd filter_probes 要按顺序运行，请运行： snakemake -s make.py 要并行运行，请使用-c和-j选项将每个作业提交到您的网格计算系统。 这将根据您的设置而有所不同。 这是在我的工作集群上使用 Grid Engine 的示例： snakemake -s make.py -j 30 -c "qsub -l h_vmem={params.h_vmem} -N {params.name} -V -j y -cwd -o {log}" 这将一次提交多达 30 个作业，每个作业请求为 Snakefil