pycgtool:从原子轨迹生成粗粒度的分子动力学模型
需积分: 46 190 浏览量
2021-05-14
13:11:50
上传
评论 1
收藏 383KB ZIP 举报
pycgtool-master.zip （96个子文件） 
pycgtool-master 
.requirements-test.txt 20B
sanitize.py 2KB requirements.txt 24B doc source mapping-only.rst 939B pycgtool.parsers.cfg.rst 151B pycgtool.util.rst 130B pycgtool.bondset.rst 139B pycgtool.frame.rst 133B conf.py 9KB pycgtool.rst 418B pycgtool.pycgtool.rst 142B pycgtool.functionalforms.rst 163B pycgtool.interface.rst 145B pycgtool.parsers.rst 236B pycgtool.mapping.rst 139B index.rst 7KB modules.rst 61B pycgtool.forcefield.rst 148B tutorial.rst 9KB make.bat 7KB tutorial_files ref.gro 2KB atenolol.bnd 63B atenolol.map 134B template.top 158B average_columns.py 1KB em.mdp 2KB Makefile 1003B npt.mdp 4KB ref-for-rgyr.tpr 11KB ref.xtc 50KB md.mdp 4KB Makefile 8KB .travis.yml 324B pycgtool.py 2KB test test_mapping.py 3KB test_interface.py 1KB test_frame.py 8KB test_util.py 8KB test_parsers_cfg.py 1KB __init__.py 0B test_bondset.py 8KB test_functionalforms.py 997B data two.gro 132B nosections.cfg 39B sugar_only.map 113B water.gro 29KB water.xtc 24KB sugar.gro 822B martini_lipids.map 12B martini_aminoacids.map 11B sugar_out.itp 1KB martini.map 60B pbcpolyethene.gro 408B sugar.bnd 205B polyethene.map 22B sugar_out.gro 329B water-cg.gro 10KB sugar.map 136B sugar-cg.gro 53KB two.map 16B polyethene.bnd 40B water.pdb 51KB twice.cfg 59B pbcwater.gro 176B water.map 22B duplicate_atoms.bnd 19B dppc.gro 104KB polyethene.gro 498B two.itp 134B dppc.map 173B sugar_out.xtc 125KB sugar.xtc 148KB triangle.bnd 18B test_pycgtool.py 3KB test_forcefield.py 387B clean.sh 50B LICENSE.md 34KB README.md 4KB pycgtool mapping.py 10KB util.py 15KB bondset.py 16KB functionalforms.py 4KB parsers __init__.py 31B cfg.py 2KB __init__.py 0B framereader.py 10KB pycgtool.py 4KB forcefield.py 6KB interface.py 9KB frame.py 9KB data water.gro 27KB atom_masses.json 93B w.itp 1KB watermodels.dat 73B martini_v2.2.itp 49KB .gitignore 119B
评论0
最新资源