MAPT

地图 命名 迄今为止，这是我最著名，最深入的项目。 结果，我觉得它应该有一个适当的名字。 由于该项目的本质是围绕（希望）将嘈杂的微生物读数映射到物种级别，因此以下名称似乎是合适的：微生物自动处理工具，简称MAPT。 用法 这是旨在简化中嘈杂读段的后处理的工作流程/管道。 需要在conda环境中安装以下软件。 GitHub存储库中提供了一个启动脚本。 这将在本页上进一步解释。 将使用以下软件（不一定按此顺序，并且此列表可能不完整）： Kong雀鱼基地电话 Kong雀鱼条形码 Cutadapt 纳米过滤 isOnclust 斯波阿 纳米图 绘图图 安装与设定 该项目是在以下版本的Singularity和Docker上构建并进行测试的。 早期版本无法保证可重复性和稳定性。 奇点（3.6.4-1.el7版或更高版本） Docker（20.10.0版或更高版本） 需要Git和Minic