RAFTS3:快速比对免费工具，用于序列相似性搜索-开源

RAFTS3可以使用台式计算机或便携式计算机在本地执行高速蛋白质搜索比较。 针对大型蛋白质数据库（例如NR和Pfam），RAFTS3的搜索速度比使用BLASTp的搜索速度快许多倍，而灵敏度损失很小，具体取决于序列的相似度。 RAFTS3是用于蛋白质序列快速比较，基因组注释和生物数据挖掘的新选择。 预印本：http://dx.doi.org/10.1101/055269在纸上评估的预先计算的数据库可从http://www.bioinfo.ufpr.br/software/rafts3下载。