转换：用于对从DC提取的数据实施转换的Python代码

该存储库的目标是提供独立的代码，使任何人都可以执行端到端ETL，从DC开始到最终可以上传到BQ的.jsonl文件结束。 转换和合并代码还会生成有关数据问题的日志，然后可以将这些日志传送到DC。 转换流 带有注释的示例患者数据，解释数据的协调，记录和合并 原始案例文件： ， ， ， 安装 克隆存储库并安装 git clone git@github.com:CancerDataAggregator/transform.git pip install -e . 要么 git clone https://github.com/CancerDataAggregator/transform.git pip install -e 从DC提取原始JSONL extract-*程序用于从DC提取数据。 例如， extract-gdc用于从GDC提取数据。 使用extract-gdc -h获取使用信