JAST:Java 组装和脚手架工具

JAST Java 组装和脚手架工具 JAST（Java Assembling and Scaffolding Tool）是一个从成对的 Illumina 文件执行组装和脚手架的程序。 它使用以下软件： 弹性条 A5 领结 天鹅绒优化器 空间 请参阅他们的许可协议以获取更多详细信息，并在使用 JAST 之前检查它们都已安装在您的计算机上。 JAST 的主要目的是让它管理几个软件之间的中间步骤。 JAST 需要所有步骤的配置文件（A5 管道除外）。 这些文件包含您要用于上述软件的选项。 每个选项必须由换行符分隔，您可以在上找到示例。 一些选项被禁止，因为它们已经被 JAST 使用（有关更多信息，请参阅帮助选项）。 要了解如何使用 JAST，请使用“-h”或“--help”选项。 例如：java -jar jast.jar -h 外部库 JAST 使用 2014 年 6 月下载的 JSA