没有合适的资源?快使用搜索试试~ 我知道了~
pipeline-v5:该存储库包含MGnify管道版本5.0的所有CWL描述
共503个文件
cwl:128个
yml:75个
py:52个
需积分: 9 0 下载量 136 浏览量
2021-05-12
20:31:05
上传
评论
收藏 194.71MB ZIP 举报
温馨提示
流水线-v5 该存储库包含MGnify管道版本5.0的所有CWL描述。 下载必要的数据库 # ---------------- common files: mkdir ref-dbs && cd ref-dbs && # download silva dbs mkdir silva_ssu silva_lsu wget \ ftp://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/metagenomics/pipeline-5.0/ref-dbs/silva_ssu-20200130.tar.gz \ ftp://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/metagenomics/pipeline-5.0/ref-dbs/silva_lsu-20200130.tar.gz tar --extract --gzip --directory=silva_
资源推荐
资源详情
资源评论
收起资源包目录
pipeline-v5:该存储库包含MGnify管道版本5.0的所有CWL描述 (503个子文件)
test.fasta.1 3KB
5s 358B
add_header 157B
awk_tool 213B
classifications.motus.biom 2.26MB
empty_json.biom 395B
LSU_json.biom 395B
ribo.claninfo 212B
mt-tmRNA.cm 51KB
tRNA5.c.cm 49KB
assembly-2.cwl 11KB
Trimmomatic-v0.36-PE.cwl 10KB
Trimmomatic-v0.36-SE.cwl 9KB
assembly-wf--v.5-cond.cwl 8KB
raw-reads-2.cwl 8KB
func_ann_and_post_processing-subwf.cwl 7KB
raw-reads-wf--v.5-cond.cwl 6KB
infernal-cmsearch-v1.1.2.cwl 6KB
Diamond.blastp-v0.9.21.cwl 5KB
Diamond.blastp-v0.9.21_docker.cwl 5KB
amplicon-2.cwl 5KB
Diamond.blastx-v0.9.21.cwl 5KB
rna_prediction-sub-wf.cwl 5KB
antismash_chunking_subwf.cwl 4KB
InterProScan-v5.cwl 4KB
raw-reads-1.cwl 4KB
amplicon-wf--v.5-cond.cwl 4KB
func_ann_and_post_proccessing-subwf.cwl 4KB
deal_with_functional_annotation.cwl 4KB
amplicon-1.cwl 3KB
qc-stats.cwl 3KB
ITS-wf.cwl 3KB
InterProScan-v5-none_docker.cwl 3KB
Diamond.makedb-v0.9.21.cwl 3KB
assembly-1.cwl 3KB
classify-otu-visualise.cwl 3KB
seqprep-subwf.cwl 3KB
functional_annotation.cwl 3KB
seqprep.cwl 3KB
cmsearch-multimodel-raw-data.cwl 3KB
biom-convert.cwl 3KB
fastp.cwl 2KB
eggnog.cwl 2KB
func_summaries.cwl 2KB
qc-filtering.cwl 2KB
fasta_chunker.cwl 2KB
trimming-not-empty-subwf.cwl 2KB
empty_tax.cwl 2KB
other_ncrnas.cwl 2KB
extract-coords_awk.cwl 2KB
antismash_v4.cwl 2KB
cmsearch-multimodel-assembly.cwl 2KB
CGC-subwf.cwl 2KB
CGC-subwf.cwl 2KB
kegg_analysis.cwl 2KB
genome_properties.cwl 2KB
mapseq2biom.cwl 2KB
gp_docker.cwl 2KB
functional_annotation_raw.cwl 2KB
cmsearch-condition.cwl 2KB
hmmscan.cwl 2KB
chunking-subwf-hmmsearch.cwl 2KB
final_chunking.cwl 2KB
eggnog-subwf.cwl 2KB
wf_antismash.cwl 2KB
cmsearch-deoverlap-v0.02.cwl 2KB
write_summaries.cwl 2KB
combined_gene_caller.cwl 2KB
functional_stats.cwl 2KB
multiple-gunzip.cwl 2KB
antismash_subwf.cwl 2KB
post-processing.cwl 2KB
chunking-subwf-IPS.cwl 2KB
get_subunits.cwl 2KB
hmmsearch.cwl 2KB
suppress_tax.cwl 1KB
predict_proteins_assemblies.cwl 1KB
trim_and_reformat_reads.cwl 1KB
prodigal.cwl 1KB
concatenate.cwl 1KB
mapseq.cwl 1KB
diamond-subwf.cwl 1KB
chunking-subwf-hmmscan.cwl 1KB
change_formats_and_names.cwl 1KB
filtering_fasta_for_antismash.cwl 1KB
protein_chunker.cwl 1KB
kegg_pathways.cwl 1KB
go_summary.cwl 1KB
hmmscan-subwf.cwl 1KB
gff_generation.cwl 1KB
fasta_chunker.cwl 1KB
FGS.cwl 1KB
esl-sfetch-manyseqs.cwl 1KB
mOTUs.cwl 1KB
return_directory.cwl 1KB
antismash_to_gff.cwl 1KB
esl-sfetch-index.cwl 1KB
predict_proteins_reads.cwl 1KB
bedtools.cwl 1KB
change_output.cwl 1KB
共 503 条
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
资源评论
清木一阳
- 粉丝: 24
- 资源: 4656
上传资源 快速赚钱
- 我的内容管理 展开
- 我的资源 快来上传第一个资源
- 我的收益 登录查看自己的收益
- 我的积分 登录查看自己的积分
- 我的C币 登录后查看C币余额
- 我的收藏
- 我的下载
- 下载帮助
最新资源
- Picasso_v3.1 2.ipa
- chromedriver-mac-arm64.zip
- 蓝zapro.apk
- chromedriver-linux64.zip
- UCAS研一深度学习实验-MNIST手写数字识别python源码+详细注释(高分项目)
- 基于Python和PyTorch框架完成的一个手写数字识别实验源码(带MINIST手写数字数据集)+详细注释(高分项目)
- 基于Matlab在MNIST数据集上利用CNN完成手写体数字识别任务,并实现单层CNN反向传播算法+源代码+文档说明(高分项目)
- NVIDIA驱动、CUDA和Pytorch及其依赖
- 基于SVM多特征融合的微表情识别python源码+项目说明+详细注释(高分课程设计)
- html动态爱心代码一(附源码)
资源上传下载、课程学习等过程中有任何疑问或建议,欢迎提出宝贵意见哦~我们会及时处理!
点击此处反馈
安全验证
文档复制为VIP权益,开通VIP直接复制
信息提交成功