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nn4dms:深度突变扫描数据的神经网络
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2021-04-02
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深度突变扫描数据的神经网络 该存储库是对我们论文的补充: 。 Sam Gelman,Sarah A Fahlberg,Pete Heinzelman,Philip A Romero + ,Anthony Gitter + 。 bioRxiv 2021. doi:10.1101 / 2020.10.25.353946 +表示相等的贡献。 我们在五个深度突变扫描数据集上训练和评估了多种类型的神经网络的性能。 该存储库包含允许您执行以下操作的代码和示例: 从我们的出版物中重新训练模型 使用我们的数据集或您自己的数据集训练新模型 使用训练有素的模型对新变体进行预测 设置 该代码基于Python 3.6和TensorFlow 1.14。 使用提供的文件通过设置合适的环境。 conda env create -f environment.yml conda activate nn4dms 安装
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nn4dms:深度突变扫描数据的神经网络 (1052个子文件)
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