海藻

藻类勘探项目 我的藻类基因勘探项目。 当前协议 从预取中下载SRA 使用vdb-validate检查MD5 使用fastq-dump转换为FASTQ 下载一些基因组和注释 地图读取到基因组和注释 从头汇编（Trinity，如果不可映射） TransDecoder获得肽 蛋酒映射器注释 鲑鱼定量 DESeq2 Wald测试（RScript） 单端分支 多样化，快速注释 关于元数据文件 必须有4列： 所有文件均带有Bioproject ID的“ Bioproject”列 “运行”列-SRR运行-每个文件一个ID “版式”列-已配对或单个 以“ C_”开头的任意数量的处理列 以“ TC_”开头的任意数量的依从治疗 标头或数据中不允许有空格或破折号； 发布 0.1：从读取到汇编 0.2 ：（当前）带DESeq2的微分表达式（Wald / LRT测试） 0.3：（wip）多个注释源。