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AnnotateUsingGenomicInfo:我编写的注释程序可以将几种数据文件类型与UCSC数据轨道进行比较
共34个文件
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2021-05-09
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AnnotateUsingGenomicInfo 我编写的注释程序可以将几种数据文件类型与UCSC数据轨道进行比较。 入门 首先,请下载最新的Java版JDK 1.8版( )。 然后,单击此存储库页面顶部的“发布”链接,或导航到: : 您可以从该链接下载最新的AnnotateUsingGenomicInfo jar文件。 为了运行AnnotateUsingGenomicInfo,您将必须使用Java 1.8可执行文件来调用它。 这是如何运行程序的示例: /path/to/jdk1.8.0/bin/java -jar /path/to/AnnotateUsingGenomicInfo.jar 运行不带任何参数的程序将列出程序帮助菜单。 数据库文件创建 为了使用此程序,您将需要在参考基因组内创建一个基因组元件位置的“数据库”。 这些区域可以是您标识的区域,也可以是公共数据库中的
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AnnotateUsingGenomicInfo-master.zip (34个子文件)
AnnotateUsingGenomicInfo-master
.gitignore 28B
README.md 7KB
manifest.mf 85B
src
annotateusinggenomicinfo
CNAssociator.java 2KB
OutputText.java 1KB
CoordFactory.java 6KB
IntersectionTool.java 1KB
OutputSecondExcel.java 12KB
CNIntersector.java 2KB
CoordMerger.java 832B
OutputExcel.java 4KB
GeneFactory.java 3KB
AnnotationFactory.java 3KB
AnnotateUsingGenomicInfo.java 5KB
ParseCommandLine.java 5KB
datastructs
SimpleCount.java 880B
AnnotationFile.java 2KB
BedCoord.java 4KB
Coord.java 1KB
CnvnatorCoord.java 3KB
CNMOPSCoord.java 3KB
AnnotationData.java 1KB
GeneBed.java 3KB
SimpleCoord.java 2KB
RPSRCoord.java 2KB
AnnotationMap.java 1KB
DellyCoord.java 2KB
.gitignore7398022713480356077tmp 36B
store
AnnotateUsingGenomicInfo.jar 823KB
build.xml 5KB
nbproject
build-impl.xml 79KB
project.properties 3KB
project.xml 965B
genfiles.properties 475B
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流浪的夏先森
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