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batch-adjust-warning-reports
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2021-05-13
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批处理调整警告报告git存储库的自述文件。 这个git资料库包含更详细的案例报告和模拟,但与文章一文中(但不包含)一起,Vegard Nygaard,Einar AndreasRødland,和Eivind Hovig,Biostat首次在线发布,2015年8月13日,doi:10.1093 / biostatistics / kxv027 目标受众是特别感兴趣的受众。 这些文档未经过同行评审,并且在发布数据之后可能会更改或更新。 案例报告的格式为html,但是底层的r代码和文本可用并且可以重新运行。 在单个.rmd文件上运行knit2html或Rstudio knitr集成,以重新生成图形和html。 重新分析/ Johnson2007 / 从原始ComBat文章中重新分析和“数据集2”的替代分析:Johnson,WE,Rabinovic,A和Li,C(2007)。 使用经验贝叶
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batch-adjust-warning-reports-master.zip (39个子文件)
batch-adjust-warning-reports-master
.gitignore 175B
README.md 3KB
commonscripts
helperfunctions.r 741B
fdist-app
theoryfunctions.r 6KB
ui.r 1KB
shinyapps
vegard
fdist-app.dcf 92B
www
styles.css 534B
bootstrap.css 141KB
F-test.r 3KB
server.r 317B
batch-adjustment-simulator
ui.r 8KB
shinyapps
vegard
batch-adjustment-simulator.dcf 126B
www
helptext.html 49KB
helperfunctions.js 2KB
styles.css 534B
bootstrap.css 141KB
batchadjustplot.r 19KB
div
shiny.css 3KB
server.r 245B
reanalysis
Leek2012
sva_tutorial_sanity_checks.rmd 7KB
sva_tutorial_sanity_checks.html 939KB
sva_tutorial_sanity_checks.md 12KB
Johnson2007
reproductionreport_johnson.md 26KB
helperfunctions_johnson.r 988B
reproductionreport_johnson.html 1.73MB
reproductionreport_johnson.rmd 25KB
data
dataExample2.txt 14.43MB
sampleInfoExample2.txt 1KB
sampleInfoExample1.txt 250B
dataExample1.txt 2.01MB
Towfic2014
reproductionreport_towfic.rmd 30KB
reproductionreport_towfic.html 1017KB
data
table_s1.csv 2KB
table_s5.csv 123KB
sampleannotation.csv 5KB
table_s2.csv 65KB
table_s4.csv 3KB
table_s3.csv 4KB
theory
F-distribution.r 3KB
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mckaywrigley
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