abSENSE：执行Weisman等人所述的同源物可检测性分析的代码。 2020年（https：www.biorxiv.orgc...

abSENSE：一种解释未检测到的同源物的方法 介绍 欢迎！ 这是abSENSE的公共Git信息库，该方法可计算在给定物种中即使通过同源搜索（使用BLAST或类似方法）也无法通过同源搜索检测到给定基因的同源物的概率。并正常发展。 这种计算的结果告诉人们如何解释同源搜索的结果，而该搜索在某些物种中找不到基因的同源物。 解释这种结果的一种可能性是该物种的基因组中实际上不存在该基因：生物学的，潜在的有趣的结果（例如，由于基因丢失或新基因的诞生）。 第二种解释，常常被忽略的是，同系物存在于该物种的基因组，但该同源性搜索仅仅是缺乏统计功率检测到它。 在这里，同系物的明显缺失是技术/统计上的限制，并且不反映基础生物学。 通过计算即使存在同源搜索，即使同源进化正常（例如，在特定分支上没有速率加速，可能暗示生物学上有趣的变化），同源搜索仍无法检测到同源的概率，abSENSE有助于解释阴性同源性搜索结