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BooleSim:系统生物学工具
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2021-05-09
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布尔网络模拟器 该软件可以可视化并交互式地模拟布尔网络,即每个节点可以采用两种可能状态之一的网络,并且使用逻辑方程式描述节点状态与其他节点状态之间的依存关系。 支持导入和导出不同的文件格式。 该软件是为生物信号级联的建模而创建的,但不仅限于此应用。 这个项目的灵感来自先前的工作(另请参见 )。 如果您有任何疑问,希望或错误报告,请随时通过打开故障单。 玩得开心! 要求 该软件是一个Web应用程序,因此可以在Web浏览器窗口中运行。 它对硬件或操作系统没有特殊要求。 浏览器必须支持HTML5,并且必须启用JavaScript。 Chrome/Chrome用于开发,因此建议使用。 用法 要使用此软件,只需浏览至 。 在我们的出版物以及Wiki在可以找到更多信息。 也可以在本地下载并运行此软件。 为此,您首先需要克隆存储库: git clone https://github.com/m
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BooleSim-gh-pages
css
rickshaw.css 7KB
visualization-svg.css 1KB
jquery-ui.css 27KB
visualization-html.css 499B
images
ui-icons_ef8c08_256x240.png 4KB
ui-icons_ffffff_256x240.png 4KB
ui-icons_222222_256x240.png 4KB
ui-bg_glass_100_f6f6f6_1x400.png 104B
progress.gif 9KB
ui-bg_diagonals-thick_20_666666_40x40.png 251B
ui-bg_gloss-wave_35_f6a828_500x100.png 4KB
ui-bg_glass_65_ffffff_1x400.png 105B
ui-bg_glass_100_fdf5ce_1x400.png 125B
ui-bg_highlight-soft_100_eeeeee_1x100.png 90B
simulator.css 4KB
.gitignore 98B
README.md 2KB
networks
boolean_cell_cycle.ginml 16KB
mammal.r 488B
rxncon 953B
metabolism.booleannet 250B
simpleX0-T-X1.sbml 3KB
include
rickshaw.js 62KB
interact.js 53KB
biographer-ui.js 360KB
libSBGN.js 29KB
d3.v2.js 198KB
jquery-1.7.2.min.js 93KB
jquery.color-2.1.1.min.js 6KB
jquery-ui-1.8.22.custom.min.js 111KB
jquery.simulate.js 4KB
pack.py 1010B
img
cursor.svg 176B
Hourglass_2.png 19KB
warning.svg 1KB
logo.png 5KB
grid.svg 336B
Hourglass_2.svg 61KB
logo.svg 3KB
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js
controls.js 24KB
infobox.js 1KB
editrule.js 4KB
steadystates.js 3KB
experimental
ginml.js 4KB
attractors.js 5KB
sbml.js 1KB
simulator.js 11KB
export.js 2KB
spellchecker.js 6KB
import.js 11KB
timeseries.js 4KB
index.html 11KB
Makefile 2KB
d3
example.net.js 189B
convert.js 987B
d3.v2.js 235KB
index.html 3KB
paper.net.js 18KB
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Alysa其诗闻
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