没有合适的资源?快使用搜索试试~ 我知道了~
ggtreeExtraArticleEnv
共40个文件
csv:21个
nwk:3个
rmd:2个
需积分: 16 1 下载量 76 浏览量
2021-04-11
17:33:30
上传
评论
收藏 1.05MB ZIP 举报
温馨提示
ggtreeExtra:丰富注释的系统发育数据的紧凑可视化 如果您在已发表的研究中使用这项工作,请引用: 徐徐,戴志国,郭鹏,傅旭辉,刘刘,周L,唐w,冯锋,陈敏,詹湛,吴武,鄂胡和余裕*。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。 ggtreeExtra:丰富注释的系统发育数据的紧凑可视化。 研究广场(Research Square) doi: (预印本)。 此回购包含要生成的源代码和数据 以上论文的补充材料。 RAWDATA:包含HMP_tree , kegg和PhyloPhlAn ,从例子下载和Methanotroph ,从下载的。 脚本:包含data使用rawdata数据集生成数据集的rawdata 。 数据:包含用于在补充文件中生成图形的所有数据集。 Rmarkdown:包含产生补充文件的源代码。 依存关系和位置 R
资源推荐
资源详情
资源评论
收起资源包目录
ggtreeExtraArticleEnv-main.zip (40个子文件)
ggtreeExtraArticleEnv-main
.github
workflows
basic_checks.yaml 2KB
vignettes
header.tex 245B
supplementary_file.Rmd 92KB
references.bib 50KB
NAMESPACE 46B
DESCRIPTION 1KB
Dockerfile 397B
inst
extdata
kegg
tippoint_attr.csv 24KB
firstring_attr.csv 165KB
secondring_attr.csv 466KB
barplot_attr.csv 26KB
kegg.nwk 21KB
overview.png 803KB
HMP_tree
tippoint_attr.csv 17KB
hmptree.nwk 11KB
ringheatmap_attr.csv 84KB
barplot_attr.csv 12KB
PhyloPhlAn
tippoint_attr.csv 89KB
barplot_attr.csv 112KB
ppal_tol.nwk 107KB
ringpoint_attr.csv 23KB
Methanotroph
Methanotroph_rpS3_Modified_Alignment_RAxML 61KB
metadata.csv 49KB
VertebrateGutMicrobiomes
data_clade_class.csv 121B
mantel.jaccard.pearson.csv 9KB
annotated_host_tree.tre 42KB
data_phylopic_uid.csv 2KB
ggtree_run.R 4KB
data_flight_bar.csv 24KB
data_diet_bar.csv 32KB
Arabidopsis_leaf_microbiome
all_stain_taxonomy.csv 18KB
Interaction_link_tab.csv 19KB
stain_tippoint.csv 7KB
BGCs_heatmap.csv 39KB
Interaction_weight.csv 22KB
.Rbuildignore 96B
README.md 7KB
Makefile 448B
.gitignore 46B
README.Rmd 4KB
共 40 条
- 1
资源评论
蓝精神
- 粉丝: 26
- 资源: 4721
上传资源 快速赚钱
- 我的内容管理 展开
- 我的资源 快来上传第一个资源
- 我的收益 登录查看自己的收益
- 我的积分 登录查看自己的积分
- 我的C币 登录后查看C币余额
- 我的收藏
- 我的下载
- 下载帮助
安全验证
文档复制为VIP权益,开通VIP直接复制
信息提交成功