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covid-uk:英国COVID-19爆发的情景分析
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2021-04-23
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英国科维奇 英国情景预测的SARS-nCoV-2传播的随机年龄结构模型。 快速入门指南 安装Mac OS的依赖项 您将需要从此处安装gfortran二进制文件: : 安装完成后,在终端中运行gcc --version以获取当前版本,例如, Target: x86_64-apple-darwin18.8.2.0 。 然后在终端中运行以下命令以添加R的库路径: cd ~ mkdir .R cd .R echo FLIBS=-L/usr/local/gfortran/lib/gcc/x86_64-apple-darwin18/8.2.0 -L/usr/local/gfortran/lib -lgfortran -lquadmath -lm >> Makevars 最后,安装nlopt: brew install nlopt 文件指南 主要参数设置和模型运行脚本在UK.R –在顶部有设置
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covid-uk-master.zip (35个子文件)
covid-uk-master
.gitignore 102B
README.md 2KB
covidm
fit_v1
mcmc.h 16KB
fit.cpp 6KB
nloptrAPI.h 18KB
R
covidm_run.R 3KB
covidm_fit.R 10KB
covidm_plot.R 3KB
covidm.R 2KB
makecontact.R 27KB
covidm_params.R 17KB
covidm_interventions.R 3KB
covidm_misc.R 5KB
plan.R 4KB
model_v1
reporter.h 3KB
helper.h 3KB
Rcpp_interface.h 6KB
process.h 1KB
corona.cpp 14KB
parameters.h 13KB
compartment.h 2KB
randomizer
distribution.h 12KB
randomizer.h 5KB
data
44000_incidence.csv 1KB
observed_cases.rds 555B
wuhan_dist.csv 780B
structure_UK.rds 108KB
all_matrices.rds 3.69MB
wpp2019_pop2020.rds 108KB
LICENSE 34KB
runset.sh 78B
UK.R 26KB
UK-view.R 36KB
data
2-linelist_symp_fit_fIa0.5.qs 718KB
Global_Mobility_Report.csv 17.1MB
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橘子乔JVZI
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