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X-Entropy:该软件包旨在计算生物分子的二面熵。 但是,它也可以计算任何可绑定数据的熵或仅计算该数据的KDE
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2021-05-01
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X熵 该库主要用于根据MD模拟数据计算二面体熵。 为此,我们使用了Z. Botev等人建议的具有自动带宽选择的KDE。 我们试图使程序包尽可能地笼统,因此,该程序包可用于计算任何数据的熵,也可用于简单地计算KDE。 安装 使用conda 这可能是安装此软件包的最简单方法。 克隆此存储库后(或直接下载conda目录),您可以使用conda轻松安装该软件包。 请注意,在这种情况下,您需要为Linux和MacOS安装Python 3.8,为Windows安装Python 3.7。 conda install -c ${ABSOLUTE_PATH_TO_XENTROPY_REPOSITORY} /conda xentropy 这应该适用于Windows 10,Linux,MacOS。 请注意,对于Windows,您需要指定conda目录的完整路径。 如果由于某种原因它不起作用,则可能必须自己
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X-Entropy:该软件包旨在计算生物分子的二面熵。 但是,它也可以计算任何可绑定数据的熵或仅计算该数据的KDE (151个子文件)
bld.bat 50B
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repodata.json.bz2 754B
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repodata.json.bz2 126B
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KDE_Tester.cpp 2KB
Integrator_Tester.cpp 2KB
Integrators.cpp 2KB
.gitignore 77B
.gitignore 6B
kde.h 7KB
Integrators.h 3KB
Exceptions.h 774B
OMPExceptionHandler.h 743B
pch.h 39B
index.html 4KB
index.html 4KB
index.html 4KB
index.html 2KB
index.html 2KB
XEntropy_example1_artificial_binodal_distribution_w_entropy.ipynb 11KB
XEntropy_example0_artificial_binodal_distribution.ipynb 6KB
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深夜里呕吐的鱼公子
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