came:从NOMe-seq识别染色质可及性-开源

染色质的可及性在基因激活和沉默的表观遗传调控中起着关键作用。 开放的染色质区域允许调节元件（例如转录因子和聚合酶）结合以表达基因，而封闭的染色质区域阻止转录机制的活性。 最近，已经开发了核小体占用和甲基化测序（NOMe-seq），用于同时分析单个分子上的染色质可及性和DNA甲基化。 但是，没有用于分析NOMe-seq数据的计算方法。 结果：在本文中，我们介绍了CAME，这是一种基于种子扩展的方法，可从NOMe-seq中识别染色质的可及性。 通过与其他现有技术在模拟数据和真实数据上的比较，证明了CAME的效率和有效性，结果表明，我们的方法不仅可以准确地识别染色质的可及性，而且优于其他方法。