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Lep-MAP3-开源
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2021-06-27
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Lep-MAP3 是一种新颖的免费链接映射软件。 它可以在单个或多个家族的大量标记和个体上构建连锁图。 尤其是支持低测序深度的全基因组测序数据。 如果您使用 Lep-MAP3,请引用 P. Rastas。 Lep-MAP3:即使对于低覆盖率的全基因组测序数据,生物信息学也能进行稳健的连锁映射。 2017, 33(23):3726-3732。 https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btx494。 请注意 Lep-Anchor 用于使用 Lep-MAP3 连锁图锚定基因组 http://sourceforge.net/projects/lep-anchor
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JoinSingles2All.java 4KB
Pileup2Likelihoods.java 15KB
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JoinIdenticalLGs.java 3KB
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qtl.R 2KB
qtlphenotypes.txt 4KB
qtlPerm.R 3KB
qtldata1.12 537KB
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Separate2$JoinSinglesThreadMaxDistance.class 3KB
OrderFinder$MergeClass.class 5KB
ParameterParser.class 7KB
ShortPath.class 10KB
OrderFinder.class 38KB
Data2.class 9KB
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OrderFinder$MergeClass$ParallelScoreCalculator$UpdateScoreThread.class 2KB
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Misc.class 9KB
JoinIdenticalLGs.class 3KB
DataParser$FileParser.class 234B
ParentCall2.class 25KB
OrderMarkers2.class 6KB
Misc$ArrayIndexComparator.class 2KB
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OrderFinder$SingleFamily$RecombinationScale.class 845B
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IBD$ParentCheckThread.class 3KB
OrderFinder$SingleFamily$RecombinationScale1.class 4KB
IBD$PairwiseThread.class 2KB
Input.class 5KB
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CharlesXiao
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