SCENT:用单细胞熵估计单细胞效能

标题 作者 日期 包裹 输出 使用 SCENT 和 CCAT 估算单细胞分化潜能的简要教程 名称 联系 安德鲁·E·特申多夫 中国科学院计算生物学重点实验室，PICB，SINH 伦敦大学学院 UCL 癌症研究所 2020-10-26 香味 BiocStyle::html_document toc_float 真的 概括 SCENT包的主要目的是提供一种评估单细胞分化能力的方法，而无需假设先验生物学知识，例如标记表达或时间点。 在高辍学率可能妨碍使用标记基因的情况下，在分化层次尚未建立的复杂组织的快照 scRNA-Seq 数据集中，或在人们可能想要识别推定的癌症组织中，这可能尤其重要。癌症干细胞表型。 安装 安装： library( devtools ) devtools :: install_github( " aet21/SCENT " ) 参考 Teschendorff AE