没有合适的资源?快使用搜索试试~ 我知道了~
thesisToolsOmics
共73个文件
rd:39个
r:26个
description:1个
需积分: 5 0 下载量 11 浏览量
2021-04-04
22:38:32
上传
评论
收藏 235KB ZIP 举报
温馨提示
thesisToolsOmics 我的生物学硕士论文中用于分析代谢组学的脚本和管道。 使用Germain A,Ruppert D,Levine SM,Hanson MR中发现的其他代谢组学数据集。 来自肌性脑脊髓炎/慢性疲劳综合征的血浆代谢组学的前瞻性生物标志物涉及疾病症状的氧化还原失衡。 代谢物。 2018年12月6日; 8(4):90。 doi:10.3390 / metabo8040090。 运行单变量测试 使用rstatix对代谢组学数据进行单变量测试,并用ggplot2绘制有趣的代谢物的火山图和小提琴/大提琴盒图。 运行多变量测试 运行PCA和OPLS,并使用ggplot2绘制结果。
资源推荐
资源详情
资源评论
收起资源包目录
thesisToolsOmics-main.zip (73个子文件)
thesisToolsOmics-main
NAMESPACE 31B
DESCRIPTION 518B
R
plotOPLS.R 15KB
filterP.R 585B
createPCA.R 2KB
study2018-data.R 847B
color_manuals.R 3KB
setMetaData.R 996B
divideCols.R 321B
extractStats.R 1KB
FCthreshold.R 2KB
getOPLS.R 5KB
countCarbonsDoubleBonds.R 1KB
getPCAloadings.R 1KB
setOPLSmeta.R 725B
doOPLS.R 606B
getPCpercentages.R 476B
plotPCAscores.R 1KB
changeGGplotTxtSize.R 563B
plotPCAloadings.R 2KB
calculateFoldChange.R 2KB
plotCarbonsDoubleBonds.R 2KB
PCAprep.R 827B
plotViolinBox.R 2KB
addLinesToPlot.R 600B
filterFeatures.R 839B
getLipidType.R 1KB
plotVolcano.R 3KB
.Rbuildignore 28B
LICENSE 34KB
README.md 665B
thesisToolsOmics.Rproj 396B
data
study2018.rda 193KB
man
divideCols.Rd 401B
plotCarbonsDoublebonds.Rd 963B
featureAnnotationColors.Rd 384B
getPCAloadings.Rd 569B
hello.Rd 128B
getOPLSpermutations.Rd 401B
getOPLScorrcov.Rd 528B
groupColors.Rd 323B
createPCA.Rd 954B
plotOPLSloadings.Rd 716B
plotOPLSsummary.Rd 454B
plotPCAscores.Rd 534B
PCAprep.Rd 470B
filterFeatures.Rd 457B
plotPCAloadings.Rd 553B
getOPLSscores.Rd 403B
doOPLS.Rd 351B
getPCpercentages.Rd 430B
plotAllOPLS.Rd 997B
FCthreshold.Rd 899B
filterP.Rd 498B
plotOPLSscores.Rd 402B
plotViolinBox.Rd 729B
setOPLSmeta.Rd 465B
plotOPLSsplot.Rd 985B
getOPLSorthovip.Rd 406B
setMetaData.Rd 600B
plotOPLSpermutations.Rd 382B
addLinesToPlot.Rd 552B
extractStats.Rd 727B
getOPLSsummary.Rd 381B
colorManuals.Rd 529B
changeGGplotTxtSize.Rd 459B
getLipidType.Rd 703B
countCarbonsDoublebonds.Rd 795B
getOPLSloadings.Rd 394B
calculateFoldChange.Rd 900B
plotVolcano.Rd 879B
getOPLSvip.Rd 401B
.gitignore 40B
共 73 条
- 1
资源评论
林John
- 粉丝: 47
- 资源: 4601
上传资源 快速赚钱
- 我的内容管理 展开
- 我的资源 快来上传第一个资源
- 我的收益 登录查看自己的收益
- 我的积分 登录查看自己的积分
- 我的C币 登录后查看C币余额
- 我的收藏
- 我的下载
- 下载帮助
最新资源
资源上传下载、课程学习等过程中有任何疑问或建议,欢迎提出宝贵意见哦~我们会及时处理!
点击此处反馈
安全验证
文档复制为VIP权益,开通VIP直接复制
信息提交成功