cluster-opt-bgo:最小能量簇识别的贝叶斯全局优化

cluster-opt-bgo 最小能量簇识别的贝叶斯全局优化 该软件包包含将贝叶斯全局优化（BGO）应用于最小能量集群识别的示例。 该代码的目的是教育性的，我想很容易将其破坏。 该代码由普渡大学的开发。 任意簇的势能 我们将模块用于簇的表示及其能量的计算。 尽管ASE可以充当各种从头算式计算器的接口，但我们还是选择使用计算器，因为它内置于ASE中，因此不需要外部，潜在的专有软件。 结果，不要期望获得真正的最小能量和/或结构。 EMT适用于以下类型的原子：H，C，N，O，Al，Ni，Cu，Pd，Ag，Pt和Au。 它也适用于H，C，N和O，但是参数错误。 内容 我们简要说明此代码的每个文件/文件夹中的内容。 有关更多详细信息，建议您查看大量注释。 ：演示如何使用BGO查找二进制分子的键长。 ：演示如何使用BGO查找任意簇的最小能量结构。 ：包括一些例程，这些例程允许在距离矩阵