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Trowel - Sequencing Error Corrector:用于Illumina测序读取的纠错模块-开源
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2021-04-30
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Trowel是用于Illumina测序读取的错误校正模块,它基于k-mer光谱方法。 该工具是第一个使用质量阈值而不是覆盖范围临界值来提取可信k-mers的工具。 该工具可确保高精度和高速度。 此工具自2013年1月21日起由Euncheon Lim在马克斯-普朗克发展生物学研究所Detlef Weigel教授的实验室中开发。 首先,您必须安装boost(> = 1.53.0),google sparse hash(> = 2.0.2),GCC(> = 4.6),autoconf(= 2.69)和automake(= 1.13)的确切版本)。
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