nbt_spatial_backmapping：手稿的代码源：单细胞表达分析和空间映射到起源组织

单细胞表达谱分析和空间映射到起源组织 您将在此存储库中找到用于执行手稿中提供的分析的R源代码。 将使用简单（组成）的示例数据集来介绍不同的功能和全局工作流程。 也可以使用手稿中使用的数据，但需要更多的计算能力。 下面介绍的工作流没有详细介绍所使用的功能，为此，请参见文件spatial_mapping.R的带注释的代码。 示例数据集 示例数据集位于example_dataset文件夹中，您可以通过将项目下载为.zip文件或克隆计算机上的git存储库来获取它们。 示例数据集分为3个文件： example_data_RNA_seq.csv ：包含10个细胞（行）和10个基因（列）的一些假RNA-seq计数值，在此步骤之前将方法应用于您的数据时，应该只用与图谱重叠的有趣基因来清理数据选择后，根据一些测序质量控制选择细胞，并可能进行标准化。 example_data_atlas.csv ：包含