# Generalized Linear Mixed-Effects Modeling in R
This two-day workshop will focus on generalized linear mixed-effects models (GLMMs; hierarchical/multilevel models) using the R programming language. We will concentrate on practical elements of GLMMs such as choosing a modeling approach, the process of building up and understanding a model, model checking, and plotting and interpreting model output. We will focus mainly on linear mixed-effects models, but we will also cover generalized linear mixed-effect models, variance and correlation structures, and zero-inflated models.
By the end of the two-day workshop, you will be able to develop models using your own data and troubleshoot the main problems that arise in the process. You will also become familiar with a number of R packages that can fit GLMMs (e.g. lme4, nlme, glmmTMB) and R packages to help manipulate and plot your data and models (e.g. dplyr, ggplot2, broom).
Prior to taking this workshop, you should be reasonably comfortable with R and linear regression, and ideally have some experience with GLMs (e.g. logistic regression). Some background with dplyr and ggplot2 would be helpful.
## Downloading these notes/exercises
<https://github.com/seananderson/glmm-course>
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## Generating the exercises
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``` r
source("99-make.R")
```
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glmm-course:关于R中的回归,GLM,混合效果模型和GLMM的研讨会练习
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R中的广义线性混合效应建模 这个为期两天的研讨会将重点介绍使用R编程语言的广义线性混合效应模型(GLMM;分层/多级模型)。 我们将专注于GLMM的实际元素,例如选择建模方法,建立和理解模型的过程,模型检查以及绘制和解释模型输出。 我们将主要关注线性混合效应模型,但还将涵盖广义线性混合效应模型,方差和相关结构以及零膨胀模型。 在为期两天的研讨会结束之前,您将能够使用自己的数据来开发模型并解决该过程中出现的主要问题。 您还将熟悉许多适合GLMM的R软件包(例如lme4,nlme,glmmTMB)和R软件包,以帮助操纵和绘制数据和模型(例如dplyr,ggplot2,broom)。 在参加此研讨会之前,您应该对R和线性回归有一定的了解,并且理想地具有一些GLM经验(例如逻辑回归)。 使用dplyr和ggplot2的一些背景会有所帮助。 下载这些说明/练习 单击“克隆或下载”,“下载ZIP
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data
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meso.csv 81KB
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pop-qcs-2015.rds 9KB
titanic.csv 59KB
chopstick-effectiveness.csv 2KB
Morph_for_Sato.csv 298KB
freitas-2016
Cod_daily_depth_data.csv 274KB
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15.5-chopsticks.Rmd 9KB
20-model-building-process.md 3KB
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99-make.R 718B
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07-grouping-structures.Rmd 6KB
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15-lmm-practice-gapminder.Rmd 7KB
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