GIANA:基于几何等距的超快速TCR聚类算法

GIANA：基于几何等距的TCR匹配算法 GIANA用于快速比对10 7 TCR高变CDR3序列。 GIANA应用数学框架执行氨基酸序列的等距编码。 ipynb文件中描述了此编码过程。 GIANA是由开发和维护的。 请将有关GIANA的问题直接发送给Bo Li： 。 GIANA是用Python3编写的，具有以下依赖关系： 安装完这些依赖​​项后，请下载最新版本的GIANA源代码（当前为v4），query.py和关联的TRBV等位基因数据（Imgt_Human_TRBV.fasta）。 用法 输入python GIANA.py -h以显示所有命令行选项： 指令 描述 -h, --help 显示此帮助消息并退出 -d DIRECTORY, --directory=DIRECTORY 输入库音序文件目录。 请确保目录中的所有文件均为输入文件。 -f FILE, --file=FIL