Koonkie：使用 Hadoop 处理环境序列信息的自动化软件工具
Dongjae Kim, Kishori M. Konwar, Niels W. Hanson, Steven J. Hallam
当前的下一代测序平台从环境样本中生成越来越庞大的文本数据集，必须通过各种生物信息学工具进行处理和解释。 处理此类数据集通常需要定制设计的软件和高性能计算资源，而这些资源又需要定期监控和维护。 传统网格系统的固有设计限制了用户控制和按需可访问性和可用性。 高速互联网带宽的最新进展以及价格合理且可扩展的云计算服务的出现为传统网格系统提供了有吸引力的替代方案。 然而，调整云计算服务以使用可用的和新兴的生物信息学工具需要非常重要的设置和专业知识。 在这里，我们展示了 Koonkie，这是一种灵活且可扩展的基于 Hadoop 的软件工具，可用于通过可扩展的云计算服务处理环境序列信息。 Koonkie
