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GSM:这项工作的目的是开发一种基因图谱系统 (GMS),通过分析患者 DNA 中包含的基因突变,帮助医生对患者进行临床诊断。
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GMS - 基因图谱系统 这项工作的目的是开发一种基因图谱系统(GMS),通过对患者 DNA 中包含的基因突变进行分析,帮助医生对患者进行临床诊断。 您将在下面找到安装说明,如果在步骤中出现问题,请向我们报告错误。 要求 JDK Apache Hadoop 1.0.4 Phyton 库(开发人员)SSH 服务器 HADOOP、SDK 和 OpenSSH 安装 1 - 下载 SDK8 和 Hadoop 1.0.4(放入文件夹下载) 2 - 获得许可 光盘下载/ chmod 775 -Rf hadoop-1.0.4.tar.gz chmod 775 -Rf jdk-8u5-linux-x64.tar.gz 3 - 解压文件 tar xvf hadoop-1.0.4.tar.gz tar xvf jdk-8u5-linux-x64.tar.gz 4 - 安装 opehssh 和密钥生成(
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GSM:这项工作的目的是开发一种基因图谱系统 (GMS),通过分析患者 DNA 中包含的基因突变,帮助医生对患者进行临床诊断。 (638个子文件)
outputs.7z 2KB
OmimVarLocusIdSNP.bcp 1.16MB
CCDS_nucleotide.current.fna 46.95MB
Backup_3_DiseaseApplication_format_4.java 42KB
Backup_CustomInputFormat.java 9KB
Backup_4_DiseaseApplication_format_4.java 8KB
Backup_d_DiseaseApplication_format_4.java 8KB
Backup_f_DiseaseApplication_format_4.java 8KB
GenesListInputFormat_format_2.java 8KB
GenesListInputFormat_format_3.java 8KB
GenesListInputFormat_format_1.java 8KB
GenesListInputFormat_format_5.java 8KB
GenesListInputFormat_format_4.java 8KB
Backup_ComputeIntensiveSequenceFileInputFormat.java 5KB
Backup_2_DiseaseApplication_format_4.java 5KB
Backup_1_DiseaseApplication_format_4.java 5KB
LICENSE 7KB
README.md 6KB
filter_GeneReport_DB_per_gene.py 6KB
create_Ensembl_DB_per_gene.py 4KB
excel2text_format_4.py 3KB
excel2text_format_2.py 3KB
excel2text_format_1.py 3KB
excel2text_format_3.py 3KB
excel2text_format_5.py 3KB
filter_CCDS_DB_per_gene.py 2KB
text2BigInput.py 809B
DB_filter.py 761B
DB_split.py 395B
tests_DiseaseApp.sh 1KB
restoreHadoop_DiseaseApp.sh 704B
initHadoop_DiseaseApp.sh 379B
setup_DiseaseApp.sh 190B
copyLogToLocal_DiseaseApp.sh 163B
compileJavaCode_DiseaseApp.sh 147B
start_DiseaseApp.sh 124B
stop_DiseaseApp.sh 111B
copyToLocal_DiseaseApp.sh 73B
removeHadoopOutput_DiseaseApp.sh 50B
removeHadoopInput_DiseaseApp.sh 49B
DB_polyphen_and_sift.txt 9.6MB
CCDS.current.txt 7.8MB
ATP8B1_5205_gene_report.txt 2.68MB
ABCB11_8647_gene_report.txt 2.1MB
PatientsData.txt 2.09MB
PatientsData.txt 2.09MB
PatientsData.txt 1.57MB
PatientsData.txt 1.57MB
ABCB4_5244_gene_report.txt 1.3MB
SERPINA1_5265_gene_report.txt 1.09MB
DB_polyphen_and_siftX.txt 1.09MB
DB_polyphen_and_sift11.txt 900KB
DB_polyphen_and_sift1.txt 862KB
DB_polyphen_and_sift3.txt 714KB
DB_polyphen_and_sift2.txt 644KB
DB_polyphen_and_sift17.txt 628KB
JAG1_182_gene_report.txt 549KB
DB_polyphen_and_sift12.txt 486KB
DB_polyphen_and_sift16.txt 476KB
DB_polyphen_and_sift7.txt 426KB
DB_polyphen_and_sift19.txt 410KB
DB_polyphen_and_sift14.txt 340KB
DB_polyphen_and_sift9.txt 328KB
DB_polyphen_and_sift5.txt 310KB
DB_polyphen_and_sift10.txt 308KB
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DB_polyphen_and_sift22.txt 176KB
genename2geneID.txt 141KB
DB_polyphen_and_sift21.txt 139KB
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ATP8B1.txt 16KB
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ABCB11_GENE.txt 5KB
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