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MasterThesis_Public_Notes
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2021-04-06
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塞巴斯蒂安·冯·罗兹(Sebastian von Rotz)的硕士论文笔记 这是我的主论文“使用纳米Kong长读技术进行扩增子测序的生物信息学工作流程的评估和开发”的所有注释,该论文在ZHAW的EGSB小组进行。 注释可以通过非黑体的方式进行导航,因为注释是用黑曜石md构建的。 ![[粘贴图片20210406151841.png]] POND框架 本文的主要成果之一就是POND框架。 该框架启用了基于脚本的简单方法,可使用Slurm Workload Manager在远程服务器上自动处理纳米Kong数据。 它需要一个unix shell来设置别名命令和安装每个处理步骤所需的工具。 这些工具可以作为模块使用,也可以与本地用户一起安装。 每个脚本都可以逐步运行,但是用户已检查相关脚本是否先于彼此被处理。 在slurm环境中使用dependency命令实现自动化。 该框架作为一个单独的存储库托
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Task - 04 - Bioinformatics Tools Assessment.md 2KB
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Task - 08 - Log Publications for Theory.md 2KB
Task - 05 - Setup of the Mater Thesis.md 1KB
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Task - 15 - Git Commands.md 725B
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naming_framework.md 708B
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Tools for Master Thesis.md 681B
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Meeting - 05.md 572B
Meeting - 07.md 564B
06_basecalling_flappie.md 521B
Task - 01 - Reannotation of Papers for Citavi.md 450B
ma_task_07_DataAndWorkflowVisualization.md 402B
Task - 14 - Tracking of Thesis Writing Progress.md 398B
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